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我的硅纳米片是半羟基取代的,现在要负载上金属,比如金。我先尝试了一个金负载在硅纳米片上,然后用cp2k进行结构优化,我的inp文件如下所示
&GLOBAL
PROJECT SiOH_Au ! 项目名称
RUN_TYPE GEO_OPT ! 计算类型:结构优化
PRINT_LEVEL MEDIUM ! 打印信息详细程度
&END GLOBAL
&FORCE_EVAL
METHOD Quickstep
&DFT
POTENTIAL_FILE_NAME GTH_POTENTIALS
BASIS_SET_FILE_NAME BASIS_MOLOPT
# LSD .TRUE.
&MGRID
CUTOFF 600 ! 平面波截断能 (Ry)
REL_CUTOFF 65 ! 相对截断能 (Ry)
&END MGRID
&SCF
SCF_GUESS ATOMIC
EPS_SCF 1.0E-6 ! SCF收敛标准
MAX_SCF 40 ! 最大SCF迭代次数
# &SMEAR
# METHOD FERMI_DIRAC
# ELECTRONIC_TEMPERATURE 0.001 !单位是Hartree,约300K
# &END SMEAR
&OT
ALGORITHM IRAC
PRECONDITIONER FULL_SINGLE_INVERSE
MINIMIZER CG
&END OT
&OUTER_SCF .TRUE. ! 添加 OUTER_SCF 块,激活外层循环
EPS_SCF 1.0E-6 ! 外层循环收敛标准,应与内层相同或更严格
MAX_SCF 10 ! 外层循环最大迭代次数
OPTIMIZER DIIS ! 推荐 DIIS 优化器
&END OUTER_SCF
&END SCF
&XC
&XC_FUNCTIONAL PBE ! 交换关联泛函
&END XC_FUNCTIONAL
&VDW_POTENTIAL
POTENTIAL_TYPE PAIR_POTENTIAL
&PAIR_POTENTIAL
TYPE DFTD3 ! Grimme D3 色散修正
REFERENCE_FUNCTIONAL PBE
PARAMETER_FILE_NAME dftd3.dat
CALCULATE_C9_TERM .FALSE.
&END PAIR_POTENTIAL
&END VDW_POTENTIAL
&END XC
&END DFT
&SUBSYS
&CELL
A 29.028 0.0 0.0
B 0.0 25.140 0.0
C 0.0 0.0 26.307
PERIODIC XYZ
&END CELL
&TOPOLOGY
COORD_FILE_FORMAT CIF
COORD_FILE_NAME si+Au_yuan.cif
&END TOPOLOGY
&KIND Si
BASIS_SET DZVP-MOLOPT-SR-GTH
POTENTIAL GTH-PBE-q4
&END KIND
&KIND O
BASIS_SET DZVP-MOLOPT-SR-GTH
POTENTIAL GTH-PBE-q6
&END KIND
&KIND H
BASIS_SET DZVP-MOLOPT-SR-GTH
POTENTIAL GTH-PBE-q1
&END KIND
&KIND Au
BASIS_SET DZVP-MOLOPT-SR-GTH
POTENTIAL GTH-PBE-q11
&END KIND
&END SUBSYS
&PRINT
&FORCES ON
&END FORCES
&END PRINT
&END FORCE_EVAL
&MOTION
# &CONSTRAINT
# &FIXED_ATOMS
# COMPONENTS_TO_FIX XYZ
# LIST 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 ! 固定所有Si原子的序号
# &END FIXED_ATOMS
# &END CONSTRAINT
&GEO_OPT
TYPE MINIMIZATION ! 优化类型
MAX_ITER 300 ! 最大优化步数
MAX_DR 3.0E-4 ! 最大位移收敛标准 (bohr)
OPTIMIZER BFGS
&END GEO_OPT
&PRINT
&TRAJECTORY
&EACH
GEO_OPT 1
&END EACH
FILENAME =optimized.xyz
&END TRAJECTORY
&END PRINT
&END MOTION
然后优化好之后得到了restart文件和hessian文件,我下一步是不是应该提取成键参数?然后同步进行振动分析?求老师解答之后的流程该是什么样的
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