高斯计算磁盘空间不够

函数与激情 · 发表于 Post on 2018-3-4 20:54:34

我想计算一个大分子(160原子)的频率分析，集群上每个节点磁盘空间是256G，估计不够。请问将临时文件放在节点中和home本地下面两者有何差异？

zjxitcc · 发表于 Post on 2018-3-4 21:47:46

本帖最后由 zjxitcc 于 2018-3-4 22:27 编辑

比较有钱的集群，一般/home使用的是机械硬盘，而/scratch则是在SSD上，即分2块不同类型的硬盘，这样可以加快读写速度。这时候临时文件大小取决于SSD容量大小，而非那块机械硬盘的大小。
当然，也有不用SSD的，直接与/home共享一块机械硬盘，可能快速读写大文件时会慢一些。这时候临时文件和输入输出文件均在一块盘上，取决于该盘的大小。
要看是以上哪种情况。

qchem · 发表于 Post on 2018-3-28 10:07:07

读写速度的差异，不过对于高斯来说可能影响不是特别大

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[Linux] 高斯计算磁盘空间不够

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