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[科研杂谈] 中国科学家首次精确合成共轭莫比乌斯索烃

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本帖最后由 captain 于 2018-8-8 10:01 编辑

转载自科学网
相关论文在线发表于《自然—通讯》。
文章可以免费下载

https://www.nature.com/articles/s41467-018-05498-6
其中计算部分使用了Multiwfn程序。


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计算化学与分子模拟

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发表于 Post on 2018-8-8 08:20:53 | 只看该作者 Only view this author
为便于观看,文章上传至此
An isolable catenane consisting of two Mbius conjugated nanohoops.pdf (4.35 MB, 下载次数 Times of downloads: 63)

文中下图可按照《使用Multiwfn图形化研究弱相互作用》http://sobereva.com/68 的方法绘制


文中下图中的黄色的AICD图可按照此文绘制:《使用AICD 2.0绘制磁感应电流图》http://sobereva.com/294。下图中红色的是ELF等值面图,可按照此文绘制:《在Multiwfn中单独考察pi电子结构特征》http://sobereva.com/432。之后可以把Multiwfn算的ELF格点数据导出成.cub放到VMD里进一步显示得到更好效果,VMD里显示等值面图的操作过程可参考比如https://www.bilibili.com/video/av26312131

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
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发表于 Post on 2018-8-8 09:33:10 | 只看该作者 Only view this author
吐个槽,文章里面分子和RDG的颜值都好低。。。

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发表于 Post on 2018-8-8 10:04:43 | 只看该作者 Only view this author
yjmaxpayne 发表于 2018-8-8 09:33
吐个槽,文章里面分子和RDG的颜值都好低。。。


貌似没关depth cueing
另外就是视角不太理想,边缘畸变严重
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发表于 Post on 2018-8-8 10:06:53 | 只看该作者 Only view this author
这里放上我刚才利用此文SI里的坐标画的图

LOL-pi图。绘制过程参考《在Multiwfn中单独考察pi电子结构特征》


IGM图,并且原子对弱相互作用的贡献也通过着色体现了。绘制过程参考《通过独立梯度模型(IGM)考察分子间弱相互作用》(http://sobereva.com/407

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