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[新手求助] 请问用高斯计算,描述氢键比较好的基组有哪些

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楼主
如题,现用高斯计算基态和激发态下的有机小分子构型优化和红外谱、势能面,其中分子内含有氢键作用,请问目前比较公认的方法和基组有哪些?描述氢键作用比较好的基组推荐一下吧,谢谢

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发表于 Post on 2019-3-30 19:27:53 | 只看该作者 Only view this author
用心去观察这纷纷扰扰的红尘

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发表于 Post on 2019-3-31 04:38:55 | 只看该作者 Only view this author
含氢键的体系opt freq目的用6-311G**或def-TZVP就足够了

至于“势能面”指代不明。如果你想说计算单点,看实际情况而定,仔细看
谈谈量子化学中基组的选择
http://sobereva.com/336http://bbs.keinsci.com/thread-3545-1-1.html


其它相关信息看
浅谈为什么优化和振动分析不需要用大基组
http://sobereva.com/387http://bbs.keinsci.com/thread-6600-1-1.html
乱谈DFT-D
http://sobereva.com/83
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2019-4-2 00:55:39 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wuzhiyi 于 2019-4-2 04:39 编辑

sobereva老师好,我想对一个有一定共价性的O-H...O的氢键做单点结合能计算. 系统有90个原子左右,系统中只有碳氧氮氢. 但体系中有酪氨酸和組氨酸的pi-pi stacking.
系统已经用D3LYP-D3(BJ)/def2-TZVP优化完毕 因为要算键级所以没有加弥散原计划是用MP2/jul-cc-pVQZ加counterpoise算结合能
但因为集群设置的问题,只有50TB的scratch space可以用.jul-cc-pVQZ好像略微有一点大.现在想保持MP2往下减基组.
我想问一下是往def2-TZVP上加弥散函数比较明智还
还是把jul-cc-pVQZ保持弥散函数砍到3zeta
还是保持4zeta砍月份比较明智?谢谢

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发表于 Post on 2019-4-2 08:44:02 | 只看该作者 Only view this author
wuzhiyi 发表于 2019-4-2 00:55
sobereva老师好,我想对一个有一定共价性的O-H...O的氢键做单点结合能计算. 系统有90个原子左右,系统中只有 ...

别考虑MP2
像这样较大体系,MP2或双杂化用Gaussian算极其困难,如果要结果很准确,强烈建议用ORCA做PWPB95-D3(BJ)计算,基组jul-cc-pVTZ,一定要利用RI节约耗时。

如果不用双杂化,用Gaussian靠M06-2X-D3/ma-TZVP + 0.5*CP也可以得到足够合理的结果,内行审稿人绝对不会挑刺。

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2019-4-2 16:33:48 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wuzhiyi 于 2019-4-2 16:39 编辑
sobereva 发表于 2019-4-2 08:44
别考虑MP2
像这样较大体系,MP2或双杂化用Gaussian算极其困难,如果要结果很准确,强烈建议用ORCA做PWPB ...

谢谢sobereva老师,想问一下是用ma-TZVP而不是更新的ma-def2-TZVP吗?还有ma是may的意思吗?
我还是新手不太明白0.5×CP是什么意思,CP是指counterpoise么?0.5×CP是指0.5×BSSE吗?谢谢

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发表于 Post on 2019-4-2 17:40:25 | 只看该作者 Only view this author
wuzhiyi 发表于 2019-4-2 16:33
谢谢sobereva老师,想问一下是用ma-TZVP而不是更新的ma-def2-TZVP吗?还有ma是may的意思吗?
我还是新手 ...

仔细看
给ahlrichs的def2系列基组加弥散的方法
http://sobereva.com/340http://bbs.keinsci.com/thread-3487-1-1.html

0.5*CP就是用一半的counterpoise校正能,这里说了
谈谈BSSE校正与Gaussian对它的处理
http://sobereva.com/46
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发表于 Post on 2019-4-2 18:02:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-4-2 17:40
仔细看
给ahlrichs的def2系列基组加弥散的方法
http://sobereva.com/340(http://bbs.keinsci.com/thre ...

谢谢sob老师的答复 我明白了

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