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本帖最后由 naoki 于 2019-11-10 14:20 编辑
我之前帖子里那个交联聚合物用x2top生成top文件之后，我用UE列模式下改了电荷那一列，格式没改变只是数字变了，在进行能量最小化时发现程序提示我这个体系总电荷为85121.213740。我加了一下top里[ atoms ]下的电荷不到1，加了下所有原子的质量，发现就是程序提示的总电荷数。。。我对比其他以前用其它工具生成的没这个问题的itp，发现格式上也没什么区别。不知道怎么回事了来请教下各位。。。附件是top文件
程序提示：
NOTE 1 [file mpdpa1108.top, line 65702]:
System has non-zero total charge: 85121.213740
Total charge should normally be an integer. See
http://www.gromacs.org/Documentation/Floating_Point_Arithmetic
for discussion on how close it should be to an integer.
mpdpa1108.top
(3.76 MB, 下载次数 Times of downloads: 18)
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发表于 Post on 2019-11-10 14:20:36
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