计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 1767|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] Gaussian优化结构如何使用对称性?

[复制链接 Copy URL]

210

帖子

1

威望

1153

eV
积分
1383

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
如题。
各位前辈好!
最近在优化一个笼状分子(Cu、C、O、H),属于12面体,在优化结构时如何使Gaussian强制性使用对称性,
因为在尝试计算之后输出的并非很对称的结构,好像默认是使用C1来算的,我想知道怎么让GAUSSIAN可以按照原子类型等价来进行优化呢?
就如社长Mutiwfn中计算RESP时,通过eqvcons来限制拟合部分等价的原子电荷这样的思路。
是否在GAUSSIAN 16中可以实现这样的计算呢?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2023-8-26 10:28:59 | 只看该作者 Only view this author
谈谈Gaussian中的对称性与nosymm关键词的使用
http://sobereva.com/297http://bbs.keinsci.com/thread-1355-1-1.html
该说的都说了。至少先确保初始结构满足对称性。

除非内坐标写成完全满足对称性的情况(很多内坐标共享相同的变量),否则没有办法绝对保证对称性不会发生下降。
不用弥散函数、用较高质量积分格点、确保计算级别合理,有助于维持高对称性(如果是应当有的话)。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

1060

帖子

0

威望

3256

eV
积分
4316

Level 6 (一方通行)

3#
发表于 Post on 2023-8-27 22:25:46 | 只看该作者 Only view this author
可以试试先在 GaussView ——> Tools ——> Point Group 勾选左上角的 Enable Point Group Symmetry
然后可以在右上角的 Current point group: 看到你的结构当前的点群。

如果你的结构具有“潜在的”较高的对称性,但是当前结构只显示了很低的对称性。那么你看可以更改 Tolerance,比如  Loose (0.1), Very loose (0.3), Awfully loose (0.5),甚至 Do you feel lucky? (1.0),然后点击 Symmetrize,让 GaussView 帮你找更高的对称性。 最后保存找到高对称性的结构。

在保存后的高对称性结构文件中,关键词这一行(也就是 # 开头的这一行),添加 symm=loose,例如
  1. #p wB97XD/def2TZVP opt(calcfc) symm=loose freq
复制代码


如果运气好的话,可以在优化过程中保持住较高的对称性。

210

帖子

1

威望

1153

eV
积分
1383

Level 4 (黑子)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-8-28 09:17:53 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-8-26 10:28
谈谈Gaussian中的对称性与nosymm关键词的使用
http://sobereva.com/297(http://bbs.keinsci.com/thread-1 ...

谢谢社长!!!

210

帖子

1

威望

1153

eV
积分
1383

Level 4 (黑子)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-8-28 09:18:14 | 只看该作者 Only view this author
乐平 发表于 2023-8-27 22:25
可以试试先在 GaussView ——> Tools ——> Point Group 勾选左上角的 Enable Point Group Symmetry
然后 ...

多谢,在GV里找到了对称性

84

帖子

0

威望

211

eV
积分
295

Level 3 能力者

6#
发表于 Post on 2024-11-13 16:31:45 | 只看该作者 Only view this author
乐平 发表于 2023-8-27 22:25
可以试试先在 GaussView ——> Tools ——> Point Group 勾选左上角的 Enable Point Group Symmetry
然后 ...

老师您好,我最近计算遇到一个让我很不解的事。我最开始有个初始结构1,然后我对此进行了结构优化得到了一个log,该log的对称性显示的Current point group是Cs,然后Tolerance中default中显示的对称性是C3V。在这种情况下我是不是需要把对称性调成C3v再次优化?如果需要再次优化,那最终的能量应该取最低能量吗?

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-24 00:24 , Processed in 0.186233 second(s), 26 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list