气态CO2与超临界CO2环境下分子间相互作用的计算问题

李宏俊 · 发表于 Post on 2018-9-25 14:20:41

社长，以及各位大佬，我想要分别计算气态CO2、超临界CO2与分子A之间的相互作用，如下操作合适不？
1. 气态CO2与分子A之间的相互作用：正常的摆放一个分子A与CO2分子，然后优化结构，进行后续处理；
2. 超临界CO2与分子A之间的相互作用：自定义超临界CO2溶剂模型（自行选取合适的eps,epsinf没找着的话，假定其值等于eps），然后在此基础上，摆放一个分子A与CO2分子，优化结构，进行后续处理；

衷心的期待你们的指导。

agent99 · 发表于 Post on 2018-9-26 02:46:41

你这样算估计两个结果几乎一样，除非超临界CO2的介电常数很大（看起来不会）

李宏俊 · 发表于 Post on 2018-9-26 08:32:49

agent99 发表于 2018-9-26 02:46
你这样算估计两个结果几乎一样，除非超临界CO2的介电常数很大（看起来不会）

超临界CO2的介电常数大概高于气态CO2的介电常数0.3及以上。

李宏俊 · 发表于 Post on 2018-9-26 08:35:06

agent99 发表于 2018-9-26 02:46
你这样算估计两个结果几乎一样，除非超临界CO2的介电常数很大（看起来不会）

另外，不能这样算的话，可以怎样算呢？大佬可有想法

sobereva · 发表于 Post on 2018-9-26 21:18:43

epsinf不影响优化和能量计算，不需要定义
溶剂模型本来不是用于这种情况的，但你提到的计算方式也未尝不可

agent99 · 发表于 Post on 2018-9-27 02:33:29

李宏俊发表于 2018-9-25 18:32
超临界CO2的介电常数大概高于气态CO2的介电常数0.3及以上。

气体的介电常数很小的，这样的话算出来应该是没什么差别。你可以试试在气态计算中只放一个CO2分子，而在超临界计算中多放几个，因为超临界CO2的密度明显大于气态。

xingyuan · 发表于 Post on 2019-12-13 22:12:43

sobereva 发表于 2018-9-26 21:18
epsinf不影响优化和能量计算，不需要定义
溶剂模型本来不是用于这种情况的，但你提到的计算方式也未尝不可

老师，如果想计算分子A在超临界水中的自由能，将超临界水用隐形溶剂模型SMD表示出来，然后像在常温下那样计算可以吗

sobereva · 发表于 Post on 2019-12-15 10:40:58

xingyuan 发表于 2019-12-13 22:12
老师，如果想计算分子A在超临界水中的自由能，将超临界水用隐形溶剂模型SMD表示出来，然后像在常温下那样 ...

可以

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