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[Gaussian/gview] 求助,输出中间体及过渡态的能量。

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本帖最后由 明园 于 2019-11-25 17:15 编辑

社长,#p opt freq wb97xd/genecp scrf=(smd,solvent=toluene),在这个级别下优化完中间体后,首先查看了.log的HF=电子能量,但查过一些文献后,发现文献中用的都是吉布斯自由能,遂改为输出了sum of electronic and thermal Free energies=吉布斯自由能,但发现两个能量几乎相同,请问这是正确的吗?(之前上课记得HF能量是从log文件末得到的,但是我是从文件最后一大段数字中找到的,不知这样是否正确)(附件是举了一个中间体的例子,感谢指正)

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HF能量.png

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发表于 Post on 2019-11-25 18:56:19 | 只看该作者 Only view this author
并不几乎相同,差值转化成热力学数据常用的kJ/mol单位一点都不小
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-25 20:09:41 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 明园 于 2019-11-25 20:11 编辑
sobereva 发表于 2019-11-25 18:56
并不几乎相同,差值转化成热力学数据常用的kJ/mol单位一点都不小

好的谢谢社长,社长,还要麻烦您一下,在这个级别下结构优化中间体时,我直接取得sum of electronic and thermal Free energies,但是优化过渡态时,级别是#p opt=(calcall,ts,noeigen) freq pm6 scrf=(smd,solvent=toluene),发现能量和中间体相差极大,社长,请问是不是不同级别的优化不能拿在一起比较?(过渡态不加热校正量可以吗?)
不好意思社长,我把上传的东西上传到这个对话框里了,我不知道怎么删除了。

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发表于 Post on 2019-11-26 23:29:21 | 只看该作者 Only view this author
明园 发表于 2019-11-25 20:09
好的谢谢社长,社长,还要麻烦您一下,在这个级别下结构优化中间体时,我直接取得sum of electronic and  ...

PM6给的自由能垃圾得根本没法用,更何况此体系里有Pd,半经验更是难给出定性正确的数据
PM6只适合找个初猜结构,之后必须拿DFT进一步opt freq
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-27 10:01:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-11-26 23:29
PM6给的自由能垃圾得根本没法用,更何况此体系里有Pd,半经验更是难给出定性正确的数据
PM6只适合找个初 ...

好的谢谢社长。

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