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[VMD] VMD分析氢键遇到错误

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我用VMD分析Hydrogen bonds时出现了如下的错误,不知道怎么修改呢?我设置的是:










)LCQK52JEEH$~2H`AXJF$ID.png (96.32 KB, 下载次数 Times of downloads: 28)

)LCQK52JEEH$~2H`AXJF$ID.png

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发表于 Post on 2021-5-10 03:33:00 | 只看该作者 Only view this author
至少对于1.9.3版,VMD的绘图功能有bug,把Plot the data with Multiplot取消掉
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-10 08:14:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-5-10 03:33
至少对于1.9.3版,VMD的绘图功能有bug,把Plot the data with Multiplot取消掉

好的呢,谢谢了呢,我试试呢。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-10 11:20:00 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 爱模拟的bao 于 2021-5-10 15:50 编辑
爱模拟的bao 发表于 2021-5-10 08:14
好的呢,谢谢了呢,我试试呢。

老师,我可以在VMD里看到氢键[img]",但是计算出来的氢键都是零呢,这是什么原因啊?

W791$F6WNU(RZ~JA[}7DZFH.png (33.18 KB, 下载次数 Times of downloads: 26)

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发表于 Post on 2021-5-10 13:43:24 | 只看该作者 Only view this author
爱模拟的bao 发表于 2021-5-10 11:20
老师,我可以在VMD里看到氢键,但是计算出来的氢键都是零呢,这是什么原因啊?

贴图方式不对,其他人看不到。重新编辑帖子并仔细看置顶的新社员必读贴了解怎么正确贴图
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-10 15:51:18 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-5-10 13:43
贴图方式不对,其他人看不到。重新编辑帖子并仔细看置顶的新社员必读贴了解怎么正确贴图

修改了呢,老师。

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发表于 Post on 2021-5-11 05:43:51 | 只看该作者 Only view this author
爱模拟的bao 发表于 2021-5-10 11:20
老师,我可以在VMD里看到氢键",但是计算出来的氢键都是零呢,这是什么原因啊?

选区没设对
光写name O肯定不行,程序根据给体重原子和相连的氢一起来判断给体原子
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-11 09:44:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-5-11 05:43
选区没设对
光写name O肯定不行,程序根据给体重原子和相连的氢一起来判断给体原子

好的,谢谢老师。

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发表于 Post on 2021-8-26 11:04:15 | 只看该作者 Only view this author

所以你是怎么设置的啊,我也遇到了和你相同的问题

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发表于 Post on 2022-5-17 21:19:53 | 只看该作者 Only view this author
你好,请问解决了吗

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发表于 Post on 2022-5-30 06:47:53 | 只看该作者 Only view this author
LSY0202 发表于 2021-8-26 11:04
所以你是怎么设置的啊,我也遇到了和你相同的问题

http://bbs.keinsci.com/thread-30011-1-1.html
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