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[ORCA] ORCA锥形交叉点优化 SCF导数报错

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使用TDDFT优化CI点,一直到TDDFT激发能都能正常收敛,但在计算导数的时候报错:
  1. Reading the CIS file                     ... done
  2. Norm of the CI vector                    ... 1.000000000
  3. Making the CIS (pseudo)densities         ... done
  4. Making operators G(D) and Q(T)           ... [file orca_cis/cisdens.cpp, line 1005, Process 8]: Error: Cannot retrieve the V**-1 (/C basis) matrix in CIS_BuildFock_RI

  5. [file orca_cis/cisdens.cpp, line 1005, Process 9]: Error: Cannot retrieve the V**-1 (/C basis) matrix in CIS_BuildFock_RI

  6. [file orca_cis/cisdens.cpp, line 1005, Process 10]: Error: Cannot retrieve the V**-1 (/C basis) matrix in CIS_BuildFock_RI

  7. [file orca_cis/cisdens.cpp, line 1005, Process 11]: Error: Cannot retrieve the V**-1 (/C basis) matrix in CIS_BuildFock_RI

  8. [file orca_cis/cisdens.cpp, line 1005, Process 12]: Error: Cannot retrieve the V**-1 (/C basis) matrix in CIS_BuildFock_RI

  9. [file orca_cis/cisdens.cpp, line 1005, Process 13]: Error: Cannot retrieve the V**-1 (/C basis) matrix in CIS_BuildFock_RI

  10. [file orca_cis/cisdens.cpp, line 1005, Process 14]: Error: Cannot retrieve the V**-1 (/C basis) matrix in CIS_BuildFock_RI

  11. [file orca_cis/cisdens.cpp, line 1005, Process 15]: Error: Cannot retrieve the V**-1 (/C basis) matrix in CIS_BuildFock_RI

  12. [file orca_cis/cisdens.cpp, line 1005, Process 16]: Error: Cannot retrieve the V**-1 (/C basis) matrix in CIS_BuildFock_RI

  13. [file orca_cis/cisdens.cpp, line 1005, Process 17]: Error: Cannot retrieve the V**-1 (/C basis) matrix in CIS_BuildFock_RI

  14. [file orca_cis/cisdens.cpp, line 1005, Process 18]: Error: Cannot retrieve the V**-1 (/C basis) matrix in CIS_BuildFock_RI

  15. [file orca_cis/cisdens.cpp, line 1005, Process 19]: Error: Cannot retrieve the V**-1 (/C basis) matrix in CIS_BuildFock_RI

  16. [file orca_cis/cisdens.cpp, line 1005, Process 20]: Error: Cannot retrieve the V**-1 (/C basis) matrix in CIS_BuildFock_RI
  17. [file orca_cis/cisdens.cpp, line 1005, Process 21]: Error: Cannot retrieve the V**-1 (/C basis) matrix in CIS_BuildFock_RI

  18. [file orca_cis/cisdens.cpp, line 1005, Process 22]: Error: Cannot retrieve the V**-1 (/C basis) matrix in CIS_BuildFock_RI

  19. [file orca_cis/cisdens.cpp, line 1005, Process 23]: Error: Cannot retrieve the V**-1 (/C basis) matrix in CIS_BuildFock_RI

  20. [file orca_cis/cisdens.cpp, line 1005, Process 24]: Error: Cannot retrieve the V**-1 (/C basis) matrix in CIS_BuildFock_RI
  21. [file orca_cis/cisdens.cpp, line 1005, Process 25]: Error: Cannot retrieve the V**-1 (/C basis) matrix in CIS_BuildFock_RI

  22. [file orca_cis/cisdens.cpp, line 1005, Process 26]: Error: Cannot retrieve the V**-1 (/C basis) matrix in CIS_BuildFock_RI

  23. [file orca_cis/cisdens.cpp, line 1005, Process 27]: Error: Cannot retrieve the V**-1 (/C basis) matrix in CIS_BuildFock_RI

  24. [file orca_cis/cisdens.cpp, line 1005, Process 0]: Error: Cannot retrieve the V**-1 (/C basis) matrix in CIS_BuildFock_RI

  25. [file orca_cis/cisdens.cpp, line 1005, Process 1]: Error: Cannot retrieve the V**-1 (/C basis) matrix in CIS_BuildFock_RI

  26. [file orca_cis/cisdens.cpp, line 1005, Process 2]: Error: Cannot retrieve the V**-1 (/C basis) matrix in CIS_BuildFock_RI

  27. [file orca_cis/cisdens.cpp, line 1005, Process 3]: Error: Cannot retrieve the V**-1 (/C basis) matrix in CIS_BuildFock_RI

  28. [file orca_cis/cisdens.cpp, line 1005, Process 4]: Error: Cannot retrieve the V**-1 (/C basis) matrix in CIS_BuildFock_RI

  29. [file orca_cis/cisdens.cpp, line 1005, Process 5]: Error: Cannot retrieve the V**-1 (/C basis) matrix in CIS_BuildFock_RI

  30. [file orca_cis/cisdens.cpp, line 1005, Process 6]: Error: Cannot retrieve the V**-1 (/C basis) matrix in CIS_BuildFock_RI

  31. [file orca_cis/cisdens.cpp, line 1005, Process 7]: Error: Cannot retrieve the V**-1 (/C basis) matrix in CIS_BuildFock_RI


  32. -------------------------------------------------------
  33. Primary job  terminated normally, but 1 process returned
  34. a non-zero exit code.. Per user-direction, the job has been aborted.
  35. -------------------------------------------------------
  36. --------------------------------------------------------------------------
  37. mpirun detected that one or more processes exited with non-zero status, thus causing
  38. the job to be terminated. The first process to do so was:

  39.   Process name: [[57488,1],1]
  40.   Exit code:    2
  41. --------------------------------------------------------------------------

  42. ORCA finished by error termination in SCF gradient
复制代码

不开RI也一样报错:
  1. -------------------
  2. TD-DFT/TDA GRADIENT
  3. -------------------

  4. Reference wavefunction             ... RHF
  5. State of interest                  ... 1
  6. Basis dimension                    ... 256
  7. DFT-XC contribution needed         ... YES
  8. RI-approximation                   ... OFF
  9. CIS-vectors being read from        ... cis_ciopt1.cis

  10. => Number of Vectors found: 2
  11. => Orbital Window: 14...47 -> 48...255

  12. Reading the CIS file                     ... done
  13. Norm of the CI vector                    ... 1.000000000
  14. Making the CIS (pseudo)densities         ... done
  15. Making operators G(D) and Q(T)           ... -------------------------------------------------------
  16. Primary job  terminated normally, but 1 process returned
  17. a non-zero exit code.. Per user-direction, the job has been aborted.
  18. -------------------------------------------------------
  19. --------------------------------------------------------------------------
  20. mpirun detected that one or more processes exited with non-zero status, thus causing
  21. the job to be terminated. The first process to do so was:

  22.   Process name: [[59786,1],26]
  23.   Exit code:    64
  24. --------------------------------------------------------------------------

  25. ORCA finished by error termination in SCF gradient
复制代码


输入文件参数如下:
  1. !PBE0 def2-SVP def2/J RIJCOSX
  2. !CI-Opt
  3. %maxcore 4000
  4. %pal nprocs  28 end
  5. %conical
  6. tddft_NRoots 2
  7. tddft_IRoot 1
  8. end
复制代码
想问问这个要怎么解决呢
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发表于 Post on 2021-2-1 15:39:26 | 只看该作者 Only view this author
是不是内存不够或硬盘空间不够
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-2-1 16:01:30 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-2-1 15:39
是不是内存不够或硬盘空间不够

貌似不是,内存用16个G也是一样。而且内存不足应该有其他报错吧,ORCA的TDDFT也不是什么吃内存和硬盘的任务
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发表于 Post on 2021-2-1 19:24:50 | 只看该作者 Only view this author
TDDFT优化CI听说有bug

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-2-1 19:26:12 | 只看该作者 Only view this author
biogon 发表于 2021-2-1 19:24
TDDFT优化CI听说有bug

这样吗?那其他方法还有支持的吗,手册里我好像就看到TDDFT和CASSCF
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发表于 Post on 2021-2-1 20:13:55 | 只看该作者 Only view this author
你先用你当前的关键词跑一下ORCA手册里乙烯的CI的那个例子看是否能成功

TDDFT优化CI我倒没听说过有bug,不过ORCA目前版本的普通TDDFT优化一些体系的CI的可靠性比较有限,可能以后会支持SF-TDDFT优化CI会好很多
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-2-1 21:25:52 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-2-1 20:13
你先用你当前的关键词跑一下ORCA手册里乙烯的CI的那个例子看是否能成功

TDDFT优化CI我倒没听说过有bug, ...

确实,现在无论是我的关键词,还是ORCA手册里对应的关键词,计算手册里乙烯的例子同样会报错,都是计算梯度的时候报错。是我安装的问题吗?
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发表于 Post on 2021-2-1 22:04:09 | 只看该作者 Only view this author
wxhwbh 发表于 2021-2-1 21:25
确实,现在无论是我的关键词,还是ORCA手册里对应的关键词,计算手册里乙烯的例子同样会报错,都是计算梯 ...

那先串行看看能否正常运行

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-2-1 23:55:02 | 只看该作者 Only view this author
biogon 发表于 2021-2-1 22:04
那先串行看看能否正常运行

试过了,串行也一样
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发表于 Post on 2021-2-3 05:16:21 | 只看该作者 Only view this author
wxhwbh 发表于 2021-2-1 21:25
确实,现在无论是我的关键词,还是ORCA手册里对应的关键词,计算手册里乙烯的例子同样会报错,都是计算梯 ...

我用windows ORCA 4.2.1跑过手册里的乙烯的例子,能正常完成
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2021-2-3 23:30:06 | 只看该作者 Only view this author
wxhwbh 发表于 2021-2-1 23:55
试过了,串行也一样

重装一个orca吧,我这试了串行并行都能正常运行的

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-2-4 20:09:03 | 只看该作者 Only view this author
biogon 发表于 2021-2-3 23:30
重装一个orca吧,我这试了串行并行都能正常运行的

我也不明白了。我现在无论串行还是并行都无法运行这个任务。串行时也是在计算导数时报错:
  1. Reading the CIS file                     ... done
  2. Norm of the CI vector                    ... 1.000000000
  3. Making the CIS (pseudo)densities         ... done
  4. Making operators G(D) and Q(T)           ...
  5. !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
  6. !!!                        FATAL ERROR ENCOUNTERED               !!!
  7. !!!                        -----------------------               !!!
  8. !!!                          I/O OPERATION FAILED                !!!
  9. !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!

  10. ORCA finished by error termination in SCF gradient
  11. Calling Command: orca_scfgrad test.scfgrad.inp
  12. [file orca_tools/qcmsg.cpp, line 458]:
  13.   .... aborting the run

  14. [file orca_tools/qcmsg.cpp, line 458]:
  15.   .... aborting the run
复制代码


重装了几个版本,都是一样的问题。但是运行其他的任务就能正常结束。而且我发现我以前在虚拟机安装的ORCA 4.2.0是能正常运行CI优化的这个任务的,在集群上就是死活运行不了。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-2-4 20:09:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-2-3 05:16
我用windows ORCA 4.2.1跑过手册里的乙烯的例子,能正常完成

我也不明白了。我现在无论串行还是并行都无法运行这个任务。串行时也是在计算导数时报错:
Reading the CIS file                     ... done
Norm of the CI vector                    ... 1.000000000
Making the CIS (pseudo)densities         ... done
Making operators G(D) and Q(T)           ...
!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
!!!                        FATAL ERROR ENCOUNTERED               !!!
!!!                        -----------------------               !!!
!!!                          I/O OPERATION FAILED                !!!
!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!

ORCA finished by error termination in SCF gradient
Calling Command: orca_scfgrad test.scfgrad.inp
[file orca_tools/qcmsg.cpp, line 458]:
  .... aborting the run

[file orca_tools/qcmsg.cpp, line 458]:
  .... aborting the run


重装了几个版本,都是一样的问题。但是运行其他的任务就能正常结束。而且我发现我以前在虚拟机安装的ORCA 4.2.0是能正常运行CI优化的这个任务的,在集群上就是死活运行不了。
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发表于 Post on 2021-2-5 10:44:06 | 只看该作者 Only view this author
wxhwbh 发表于 2021-2-4 20:09
我也不明白了。我现在无论串行还是并行都无法运行这个任务。串行时也是在计算导数时报错:
Reading the C ...

看看是不是硬盘快满了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-2-5 11:20:28 | 只看该作者 Only view this author
pwzhou 发表于 2021-2-5 10:44
看看是不是硬盘快满了

不是。我重新试了一下,如果把输入文件放在orca的安装目录里直接运行,是可以正常运行的。但是配置PATH后在其他目录运行就是不行。而且不是一开始不能运行,都是在计算导数这一步出的问题。这都是串行运行的情况,PATH也正常配置了(否则一开始就不能运行)。
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