Namd报错：ERROR: Exceeded RATTLE iteration limit for atom 12001!

zhangxiao198939 · 发表于 Post on 2020-6-18 00:01:41

大家好，
我在跑smd时，跑到8600步出现报错：ERROR: Exceeded RATTLE iteration limit for atom 12001!
整个分子体系散开；用NPT系综时，温度也控制不住，直线上升；
想问问大家在跑smd时如何控制温度，以及如上错误是什么问题。
谢谢！

fhh2626 · 发表于 Post on 2020-6-18 09:36:13

跑平衡模拟没问题吗？

把你的conf文件发来看看

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[NAMD] Namd报错：ERROR: Exceeded RATTLE iteration limit for atom 12001!