分子动力学模拟水中COF多孔骨架材料的电荷计算求助

xinxinup · 发表于 Post on 2020-7-12 20:14:41

我最近用分子动力学来模拟水溶液中二维多孔骨架材料COF，COF是由有机小分子合成出来的，但又不像石墨烯刚性那么强。跑分子动力学的时候，一般都将COF固定住不动，或者只让COF孔壁上的基团动起来。目前看了三篇文献都是用的CHELPG电荷。但我看完卢老师的博文，RESP电荷好像更适合有机体系。
想请教下大家，RESP电荷一定比CHELPG电荷好吗，RESP电荷是加强版吗？

naoki · 发表于 Post on 2020-7-12 21:17:33

用啥电荷显然和你用啥力场有关可以看下sob老师的帖子 Google搜论坛也能搜到不少讨论

xinxinup · 发表于 Post on 2020-7-12 22:02:32

本帖最后由 xinxinup 于 2021-12-15 09:19 编辑

naoki 发表于 2020-7-12 21:17
用啥电荷显然和你用啥力场有关可以看下sob老师的帖子 Google搜论坛也能搜到不少讨论

还想请教下，RESP电荷一定会比ESP电荷更准确吗？
我用的Dreiding通用力场，原文献中没有交代原子电荷的计算。

sobereva · 发表于 Post on 2020-7-13 09:18:31

xinxinup 发表于 2020-7-12 22:02
还想请教下，RESP电荷一定会比ESP电荷更准确吗？
我用的Dreiding通用力场，原文献中没有交代原子偏电荷 ...

你根本没搞清楚RESP电荷和拟合静电势电荷是什么关系。明明RESP就是拟合静电势电荷的一种。“ESP电荷”根本没有确切指代。
仔细看此文
RESP拟合静电势电荷的原理以及在Multiwfn中的计算
http://sobereva.com/441（http://bbs.keinsci.com/thread-10880-1-1.html）

我在博文里已经明确说了

对于模拟刚性分子的情况，MK和CHELPG电荷都非常适合，不需要考虑其它原子电荷计算方法

RESP电荷对于任何体系都可以用，只不过是有没有必要必须用的问题而已。

那叫原子电荷，或者分数电荷，没有“原子偏电荷”这个词

liqhua · 发表于 Post on 2020-11-2 22:54:11

请问下，这种周期体系的top文件怎么建立？

sobereva · 发表于 Post on 2020-11-15 10:20:37

liqhua 发表于 2020-11-2 22:54
请问下，这种周期体系的top文件怎么建立？

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