求助亚油酸优化后分子结构改变

Bao · 发表于 Post on 2020-12-4 10:53:36

本人新手小白自学，恳求各位大佬帮忙。
用高斯16对亚油酸进行优化，先用6-311G**基组优化结果碳链断裂。改用Def2-TZVP和6-311g(2d,p)基组优化，亚油酸双键消失，由于考虑高斯主要计算键长等问题，用6-311g(2d,p)基组优化后进行柔性扫描，又发生断键现象。
想求助各位大佬，是什么原因导致断键现象的发生，感谢！
图片是6-311g(2d,p)基组优化和柔性扫面后结构。

阿甘 · 发表于 Post on 2020-12-4 10:55:01

这个亚油酸好像没画对呀

snljty · 发表于 Post on 2020-12-4 10:59:12

没有所谓的"断键"现象，量子化学计算根本不考虑图上有几根化学键。只是键长偏离了常见范围，GaussView显示键型会和预期不符。
你也没说你用的到底是什么方法。(后HF？泛函(哪种泛函？)？HF？)

Bao · 发表于 Post on 2020-12-4 11:28:08

snljty 发表于 2020-12-4 10:59
没有所谓的"断键"现象，量子化学计算根本不考虑图上有几根化学键。只是键长偏离了常见范围，GaussView显示 ...

不好意思我用的是ub3lyp方法

FETEYA · 发表于 Post on 2020-12-4 11:33:52

能给出你的输入文件吗

wzkchem5 · 发表于 Post on 2020-12-4 11:40:21

把初始结构贴上来，不要贴图片，贴gjf

Bao · 发表于 Post on 2020-12-4 11:45:32

FETEYA 发表于 2020-12-4 11:33
能给出你的输入文件吗

柔性扫描输入文件

wzkchem5 · 发表于 Post on 2020-12-4 11:56:50

Bao 发表于 2020-12-4 11:45
柔性扫描输入文件

初始结构画错了。
仔细对照亚油酸的结构，把每个碳上面的氢原子数画对，每个碳碳双键的顺反画对，并且确定不该成键的原子之间不要距离太近，再计算。

Bao · 发表于 Post on 2020-12-4 12:25:49

wzkchem5 发表于 2020-12-4 11:40
把初始结构贴上来，不要贴图片，贴gjf

初始结构

Bao · 发表于 Post on 2020-12-4 12:29:38

wzkchem5 发表于 2020-12-4 11:56
初始结构画错了。
仔细对照亚油酸的结构，把每个碳上面的氢原子数画对，每个碳碳双键的顺反画对，并且确 ...

好的谢谢老师

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