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[综合交流] 氧化呋咱环开环的键解离能计算求助

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本人在想计算一个氧化呋咱环开环的键解离能,想请教应该如何设计方案?(分子内存在一定的共轭)之前关于键解离能的计算水平与计算方法帖子中提到的扭转能应该如何计算?
其次就是如果我把轨迹文件中的开环结构直接取出,充当开环以后的结构,并与原结构直接相减计算解离能是否可行?
分子结构与断键位置如下所示:


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发表于 Post on 2020-7-30 00:21:58 | 只看该作者 Only view this author
没有办法严格计算,和周围部分耦合也非常显著

我不知道你说的轨迹是什么轨迹。开环过程的能量变化不仅在于这个键,还有其它诸多显著的来源,诸如结构的严重变形、共轭特征的改变等,如果你计算键解离能的目的是衡量这个键的强度,那不适合
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-30 09:28:07 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-7-30 00:21
没有办法严格计算,和周围部分耦合也非常显著

我不知道你说的轨迹是什么轨迹。开环过程的能量变化不仅在 ...

谢谢老师的回答,我这里提到的轨迹文件是该分子热分解动力学的轨迹文件。

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发表于 Post on 2020-8-9 05:48:20 | 只看该作者 Only view this author
山妖 发表于 2020-7-30 09:28
谢谢老师的回答,我这里提到的轨迹文件是该分子热分解动力学的轨迹文件。

不能。直接MD里取的结构,几何变量都是扭曲的
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发表于 Post on 2020-8-9 22:05:14 | 只看该作者 Only view this author
我觉得你这个没法直接算键能。开环的时候,很可能中间有一个过渡态,变成一个双键上连着两个亚硝基的结构。

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发表于 Post on 2022-5-3 15:31:56 | 只看该作者 Only view this author
所以楼主最后怎么计算的呀
用心去观察这纷纷扰扰的红尘

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