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[新手求助] 结合能计算为正值而RDG却显示有氢键相互作用

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如图中体系,优化关键词#p opt freq b3lyp/6-31g(d,p) scrf em=gd3bj out=wfn,算结合能关键词#p M062X/6-311+G(2d,p) scrf=SMD EmpiricalDispersion=GD3,算的结合能为0.1344 KJ/mol,从结合能上看应该是不具有结合作用的,但是做RDG分析时却显示有氧-氢键。请问这是因为什么原因?

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发表于 Post on 2021-3-1 15:21:43 | 只看该作者 Only view this author
溶剂效应会极大地削弱静电主导的相互作用能,从结合前后的溶解自由能的变化上便知。

拿NCI方法讨论结合强度只适合与气相下计算的结合能做对比。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-1 15:43:30 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-3-1 15:21
溶剂效应会极大地削弱静电主导的相互作用能,从结合前后的溶解自由能的变化上便知。

拿NCI方法讨论结合 ...

谢谢老师解答
1.“结合前后的溶解自由能” 是指用复合物的溶解自由能减去两个单体的溶解自由能吗?
2.其中碳骨架单体不溶于水,算溶解自由能也可以吗?
3.有其他的方法可以展示液相下的结合强度吗

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发表于 Post on 2021-3-1 15:57:59 | 只看该作者 Only view this author
yang2020 发表于 2021-3-1 15:43
谢谢老师解答
1.“结合前后的溶解自由能” 是指用复合物的溶解自由能减去两个单体的溶解自由能吗?
2. ...

1 “结合前后的溶解自由能的变化

2 当然可以。仔细看
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327http://bbs.keinsci.com/thread-3345-1-1.html

3 结合能
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-1 21:17:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-3-1 15:57
1 “结合前后的溶解自由能的变化”

2 当然可以。仔细看

回复1.抱歉老师。 “结合前后的溶解自由能的变化”是指用复合物的溶解自由能减去两个单体的溶解自由能吗?
回复3.像IGM、IGMH这些也不能图形化展示液相下的结合强度吗

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发表于 Post on 2021-3-2 01:25:27 | 只看该作者 Only view this author
yang2020 发表于 2021-3-1 21:17
回复1.抱歉老师。 “结合前后的溶解自由能的变化”是指用复合物的溶解自由能减去两个单体的溶解自由能吗 ...

1 是
2 你的逻辑完全不对,没有正确理解溶解自由能的影响,以及这些图形化显示方法思想的本质
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