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[Gaussian/gview] 求助有机化学反应势垒和反应热计算步骤

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请高手简述一下采用Gaussian以及Gaussview计算有机反应势垒和反应热的步骤,拿图中反应举一个例子,分享一下有关教程更好,谢谢啦

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发表于 Post on 2021-3-7 18:15:40 | 只看该作者 Only view this author
这个论坛上面有搜索框,自己搜,搜不到再来问,问的时候具体说是哪些内容你没有搜到,我们好针对性回答
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-7 19:16:15 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 kgf2021 于 2021-3-7 22:22 编辑
wzkchem5 发表于 2021-3-7 18:15
这个论坛上面有搜索框,自己搜,搜不到再来问,问的时候具体说是哪些内容你没有搜到,我们好针对性回答

用高斯计算势垒和反应热的方法都没搜到,具体的话,回答一下图里面最简单的就行,乙烷消氢生成乙炔反应,谢啦计算反应热时,我用高斯优化完反应物和生成物之后,将反应物的能量减去生成物的能量,得到的反应热为38.57,和图中不一样。


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发表于 Post on 2021-3-7 19:29:50 | 只看该作者 Only view this author
kgf2021 发表于 2021-3-7 19:16
用高斯计算势垒和反应热的方法都没搜到,具体的话,回答一下图里面最简单的就行,乙烷消氢生成乙炔反应, ...

http://sobereva.com/460
看完如果有不懂的,摘引原句针对性提问
Zikuan Wang
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-7 20:01:48 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-3-7 19:29
见http://sobereva.com/460
看完如果有不懂的,摘引原句针对性提问

乙烷消氢生成乙炔反应是吸热反应,过渡态结构更偏向乙烯,用TS算的话,初猜结构我还是不知道怎么猜

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发表于 Post on 2021-3-7 20:12:40 | 只看该作者 Only view this author
kgf2021 发表于 2021-3-7 20:01
乙烷消氢生成乙炔反应是吸热反应,过渡态结构更偏向乙烯,用TS算的话,初猜结构我还是不知道怎么猜

如果需要TS的initial guess
可以參考
http://sobereva.com/44

我個人比較有經驗是string method

不過TS成功率通常都不太高 需要多嘗試

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-7 21:19:35 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 kgf2021 于 2021-3-7 21:34 编辑
wzkchem5 发表于 2021-3-7 19:29
http://sobereva.com/460
看完如果有不懂的,摘引原句针对性提问

# PM7 opt=modredundant nosymm                  这里nosymm代表啥   

opt里calcfc和calcall的区别

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-7 21:45:30 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 kgf2021 于 2021-3-7 22:21 编辑

我用柔性扫描找到了那个反应的过渡态,算出来的势垒为137.55,为什么反应热和势垒都和图里的有误差

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发表于 Post on 2021-3-7 22:22:52 | 只看该作者 Only view this author
kgf2021 发表于 2021-3-7 21:19
# PM7 opt=modredundant nosymm                  这里nosymm代表啥   

opt里calcfc和calcall的区别

http://gaussian.com/keywords/
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发表于 Post on 2021-3-7 22:24:44 | 只看该作者 Only view this author
kgf2021 发表于 2021-3-7 21:45
我用柔性扫描找到了那个反应的过渡态,算出来的势垒为137.55,为什么反应热和势垒都和图里的有误差

贴一下文献的计算方法部分以及你的输入文件
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2021-3-7 23:49:10 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,避免有任何歧义,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“ 有机化学 反应势垒和反应热”改了,以后务必注意,下次将扣分处理

好好把此文看了
谈谈学量子化学如何正确地入门
http://sobereva.com/355http://bbs.keinsci.com/thread-4447-1-1.html

热化学数据怎么得到这里写明了
使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据
http://sobereva.com/552http://bbs.keinsci.com/thread-17494-1-1.html

这类司空见惯的问题,用论坛首页google框搜不到相关信息才怪
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-8 15:35:16 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 kgf2021 于 2021-3-8 15:40 编辑
sobereva 发表于 2021-3-7 23:49
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,避免 ...

看来是我不会搜关键词,这个Shermo软件在哪可以免费下载

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发表于 Post on 2021-3-8 16:09:20 | 只看该作者 Only view this author
kgf2021 发表于 2021-3-8 15:35
看来是我不会搜关键词,这个Shermo软件在哪可以免费下载

不会搜也就算了,点链接再点链接的链接都不会吗?
http://sobereva.com/552里提到“笔者之前还写过《Shermo:计算气相分子配分函数和热力学数据的简单程序》(http://sobereva.com/315)一文”,点开http://sobereva.com/315就看到了啊
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发表于 Post on 2021-3-9 04:22:18 | 只看该作者 Only view this author
kgf2021 发表于 2021-3-8 15:35
看来是我不会搜关键词,这个Shermo软件在哪可以免费下载

在网上求助计算化学问题时的注意事项
http://sobereva.com/79http://bbs.keinsci.com/thread-57-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-9 13:54:39 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-3-8 16:09
不会搜也就算了,点链接再点链接的链接都不会吗?
http://sobereva.com/552里提到“笔者之前还写过《She ...

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