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[波函数分析求助] Multiwfn显示的NLMO轨道为什么和gaussview不同?

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本帖最后由 星斗如盘 于 2021-4-28 15:50 编辑

使用Multiwfn和gaussview分别分析苯分子的定域化分子轨道NLMO,可以看到Multiwfn显示的定域化的NLMO轨道分布在三个碳原子上,而gaussview显示的分布在四个碳原子上

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发表于 Post on 2021-4-28 13:12:56 | 只看该作者 Only view this author
isovalue不一样,左图是0.05,右图是0.02。你得都调成一样的数值才能比
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-4-28 15:46:38 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 星斗如盘 于 2021-4-28 15:49 编辑
zjxitcc 发表于 2021-4-28 13:12
isovalue不一样,左图是0.05,右图是0.02。你得都调成一样的数值才能比

和等值面没有关系

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发表于 Post on 2021-4-28 16:59:17 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zjxitcc 于 2021-4-28 17:00 编辑

用Multiwfn打开Ph-nlmo.fch文件(然后调isovalue=0.02)显示得与GV看起来没两样啊。你左图怎么来的,别是操作错了。我看目前Multiwfn自身不支持产生NLMO,你别是把其他轨道当成NLMO了。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-4-28 20:23:36 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2021-4-28 16:59
用Multiwfn打开Ph-nlmo.fch文件(然后调isovalue=0.02)显示得与GV看起来没两样啊。你左图怎么来的,别是 ...

左图,先对分子轨道定域化处理,后查看

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发表于 Post on 2021-4-28 21:58:20 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zjxitcc 于 2021-4-28 22:04 编辑
星斗如盘 发表于 2021-4-28 20:23
左图,先对分子轨道定域化处理,后查看

你这说的也太简略了连具体步骤都没有(什么功能哪个数字,我知道是定域化,但是你不给出操作步骤,我不能认为你的操作是正确的),神仙也帮不了你。“对分子轨道定域化处理”你是做的NLMO么?别是拿PM局域化轨道去跟NLMO轨道对比啊,能自己说说到底做的是哪种局域轨道么(你能回答这个问题,估计也就自己找到答案了)。

我看Multiwfn目前不能从正则轨道生成NLMO,你大概率是弄成了别的局域轨道了(例如PM局域轨道),而不同的局域轨道略有区别 是必然的
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-4-28 23:49:00 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 星斗如盘 于 2021-4-28 23:50 编辑
zjxitcc 发表于 2021-4-28 21:58
你这说的也太简略了连具体步骤都没有(什么功能哪个数字,我知道是定域化,但是你不给出操作步骤,我 ...

不好意思,我说的不够清晰,我是使用Multiwfn默认的方法,输入19 1然后查看轨道,我又仔细看了一下,确实是用默认的PM局域化轨道,我以为PM局域化方法就是Multiwfn计算NLMO的方法呢

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发表于 Post on 2021-4-29 00:25:17 | 只看该作者 Only view this author
星斗如盘 发表于 2021-4-28 23:49
不好意思,我说的不够清晰,我是使用Multiwfn默认的方法,输入19 1然后查看轨道,我又仔细看了一下,确实 ...

PM是Pipek-Mezey,NLMO是natural localized molecular orbital,两者完全不是一个东西,也并不存在一个是计算另一个的方法
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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发表于 Post on 2021-4-29 02:12:54 | 只看该作者 Only view this author
星斗如盘 发表于 2021-4-28 23:49
不好意思,我说的不够清晰,我是使用Multiwfn默认的方法,输入19 1然后查看轨道,我又仔细看了一下,确实 ...

帖子里明确说了区别
Multiwfn的轨道定域化功能的使用以及与NBO、AdNDP分析的对比
http://sobereva.com/380http://bbs.keinsci.com/thread-6053-1-1.html
轨道定域化有许多做法。比较知名的是
(1)Edmiston-Ruedenberg定域化:1963年提出。通过最大化轨道的自互斥能(亦即最小化轨道间的互斥能)来实现定域化。缺点是耗时很高,而且得算复杂的双电子积分,而且又没额外好处,故很不推荐。
(2)Boys定域化:1960年提出。应用比较广泛,通过最小化轨道涵盖的空间范围来定域化。需要利用偶极矩积分。
(3)Pipek-Mezey定域化:1989年提出,它通过最大化Mulliken原子布居数的平方和达到定域化目的,编程实现颇为简单,只需要重叠积分,而且耗时很低,被广泛使用。后来还有人提出基于其它布居分析方法来做Pipek-Mezey定域化。
(4)NLMO定域化:NLMO的N是Natural的意思。这是NBO开发者提出的定域化方法,它将高占据(Lewis型)的NBO和低占据(non-Lewis型)的NBO以一定方式混合,从而得到整数占据的定域化轨道。由于得到NLMO轨道得先产生NBO,故此方法只有NBO程序,以及也同样能做NBO分析的Molpro才支持。
以上方法计算过程需要迭代,迭代过程中不同轨道间不断混合,最后使得目标函数被最大化或最小化。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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