计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 9970|回复 Reply: 6
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] GaussView构建氧化钙与氢氧化钙晶体求助

[复制链接 Copy URL]

108

帖子

0

威望

2879

eV
积分
2987

Level 5 (御坂)


请教各位老师,怎么用GaussView构建氧化钙和氢氧化钙晶体呢?上图中对吗?


我在这个网站里面(http://www.chemspider.com/)下载了氧化钙和氢氧化钙的结构,但是明显原子数不对,请问这是什么原因?

1万

帖子

0

威望

9857

eV
积分
22093

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2021-5-8 22:07:00 | 只看该作者 Only view this author
不是,你这样构建的是分子,不是晶体。晶体结构应该去找无机物质的晶体数据库下载。如果事先不知道这两个晶体的堆积方式,是不可能从头画出来的,这和画分子不一样。
chemspider是针对生物分子/类药有机分子之类的设计的,会自动补氢,所以氢原子数不对。不要从这种数据库下载结构。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

1665

帖子

5

威望

4788

eV
积分
6553

Level 6 (一方通行)

喵星人

3#
发表于 Post on 2021-5-8 22:25:28 | 只看该作者 Only view this author
去materials project上搜一下就有了
P-3m1的晶体

Ca(HO)2_mp-23879_conventional_standard.cif

913 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 8

108

帖子

0

威望

2879

eV
积分
2987

Level 5 (御坂)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-8 22:32:08 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-5-8 22:07
不是,你这样构建的是分子,不是晶体。晶体结构应该去找无机物质的晶体数据库下载。如果事先不知道这两个晶 ...

嗯嗯嗯,谢谢老师的解答

108

帖子

0

威望

2879

eV
积分
2987

Level 5 (御坂)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-8 22:33:00 | 只看该作者 Only view this author
喵星大佬 发表于 2021-5-8 22:25
去materials project上搜一下就有了
P-3m1的晶体

谢谢老师的耐心解答。请问 P-3m1 指的是氢氧化钙的意思吗

1665

帖子

5

威望

4788

eV
积分
6553

Level 6 (一方通行)

喵星人

6#
发表于 Post on 2021-5-8 22:52:05 | 只看该作者 Only view this author
yang2020 发表于 2021-5-8 22:33
谢谢老师的耐心解答。请问 P-3m1 指的是氢氧化钙的意思吗

空间群啊。。。。上标横线打不上去

108

帖子

0

威望

2879

eV
积分
2987

Level 5 (御坂)

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-9 10:23:34 | 只看该作者 Only view this author
喵星大佬 发表于 2021-5-8 22:52
空间群啊。。。。上标横线打不上去

好的,谢谢老师

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-20 16:56 , Processed in 0.167430 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list