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[Gaussian/gview] 求助:小团簇结构优化不收敛

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从MD模拟轨迹中,提取出一个由Li+和3个分子(离子)配位形成的团簇结构,在opt B3LYP-D3(BJ)/TZVP下优化结构始终不收敛,改为opt=loose B3LYP-D3(BJ)/SVP,依旧不收敛,到了132步的时候报l9999错误,Number of steps exceeded。输出文件显示Force不是很大,但是Displacement一直降不下来,并且有震荡。
请大家帮忙看看,有什么方法能帮助这个团簇几何优化收敛吗?感谢

团簇结构.png (85.59 KB, 下载次数 Times of downloads: 46)

团簇结构.png

输出文件.png (211.34 KB, 下载次数 Times of downloads: 47)

输出文件.png

输入输出文件.rar

893.21 KB, 下载次数 Times of downloads: 9

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发表于 Post on 2021-5-20 13:46:02 | 只看该作者 Only view this author
你可要考虑先让部分结构优化好后,再添加一些结构

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娃娃儿鱼

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发表于 Post on 2021-5-20 13:55:17 | 只看该作者 Only view this author
这样相对小的体系可以考虑calcall和recalc
量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164
真·探

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发表于 Post on 2021-5-20 14:54:37 | 只看该作者 Only view this author
梯度接近0但是步长降不下来的情况,可以减小步长试试
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-20 18:14:24 | 只看该作者 Only view this author
hdhxx123 发表于 2021-5-20 13:55
这样相对小的体系可以考虑calcall和recalc
量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.c ...

谢谢,加了recalc=3还是没能收敛...

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发表于 Post on 2021-5-20 18:37:31 | 只看该作者 Only view this author
jimulation 发表于 2021-5-20 18:14
谢谢,加了recalc=3还是没能收敛...

还有一些方法在博文里,都试试吧,这种情况只能耐心一个个试了
真·探

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-20 19:19:11 | 只看该作者 Only view this author
hdhxx123 发表于 2021-5-20 18:37
还有一些方法在博文里,都试试吧,这种情况只能耐心一个个试了

是的,方法比较多,正在尝试中。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-20 21:18:49 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-5-20 14:54
梯度接近0但是步长降不下来的情况,可以减小步长试试

谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-20 21:20:09 | 只看该作者 Only view this author
jiangning198511 发表于 2021-5-20 13:46
你可要考虑先让部分结构优化好后,再添加一些结构

谢谢,我看博文中没有这个方法,这个在操作时有什么技巧不?

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发表于 Post on 2021-5-20 22:00:27 | 只看该作者 Only view this author
优化时候甭用SMD。用默认的IEFPCM
不要用def-SVP,一律用def2-SVP
四个硫在一起的结构非常诡异,怀疑这个模型的化学意义
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2021-5-21 01:59:52 | 只看该作者 Only view this author
S4是个什么鬼。。。。你怕不是把两个S8各砍了一半。。。。

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发表于 Post on 2021-5-21 03:56:20 | 只看该作者 Only view this author
喵星大佬 发表于 2021-5-20 18:59
S4是个什么鬼。。。。你怕不是把两个S8各砍了一半。。。。

我看了一下楼主的输入输出文件,这个不是问题,因为总电荷是-3,说明S4是-2价离子。
比如在锂硫电池里,S8被还原成两个[S4]2-,很合理。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-21 10:26:45 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-5-20 22:00
优化时候甭用SMD。用默认的IEFPCM
不要用def-SVP,一律用def2-SVP
四个硫在一起的结构非常诡异,怀疑这个 ...

好的,谢谢社长。S4是模拟的带2个负电的多硫离子

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-21 10:48:45 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-5-21 03:56
我看了一下楼主的输入输出文件,这个不是问题,因为总电荷是-3,说明S4是-2价离子。
比如在锂硫电池里, ...

是的 这个构型几何优化真是不容易收敛

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发表于 Post on 2021-5-21 15:43:13 | 只看该作者 Only view this author
jimulation 发表于 2021-5-21 03:48
是的 这个构型几何优化真是不容易收敛

本来溶液里面每个[S4]2-至少得有2个Li+,你抠出一个Li+和两个[S4]2-,是不是也不太符合真实情况
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
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