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[Gaussian/gview] C[n]环结构优化时达到C[24]以后卡在L101.exe不动了?

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本帖最后由 liyunlu 于 2021-6-2 17:53 编辑

最近尝试重复文献C[n]环结构优化( Aromaticity of Even-Number Cyclo[n]carbons (n=6-100), J. Phys. Chem. A 2020, 124, 51, 10849–10855. )。在n=6-22时,结构优化和频率计算都能正常进行。但n=24以后的结构优化和频率计算都不能进行,都卡在L101.exe不懂,不论是windows的G09D01,还是Linux的G16A03都是这样。但只进行单点计算可以正常计算。
这里贴出计算出入文件:
%chk=C26-opt.chk
# opt freq wb97xd/def2tzvp out=wfn
Title Card Required
0 1
C       -2.590324000         4.650570000         -0.000305000
C       -1.468481000         5.117110000         -0.000364000
C        2.354235000         4.773576000         -0.000197000
C        3.375091000         4.114686000         -0.000211000
C        4.301706000         3.131710000         -0.000100000
C        4.899518000         2.073916000         -0.000074000
C        5.020394000        -1.762606000         0.000268000
C        5.301920000        -0.441372000         0.000116000
C        4.490326000        -2.855883000         0.000242000
C        2.649878000        -4.616857000         0.000291000
C        1.402577000        -5.135657000         0.000314000
C        0.201633000        -5.319988000         0.000262000
C       -1.143820000        -5.198997000         0.000242000
C       -2.292671000        -4.803521000         0.000182000
C       -3.427568000        -4.070812000         0.000075000
C       -4.261073000        -3.186747000         0.000107000
C       -4.925725000        -2.010694000         -0.000022000
C       -5.042705000         1.697935000         -0.000127000
C       -5.295805000         0.509575000         -0.000154000
C        3.627295000        -3.895160000         0.000330000
C       -3.677105000         3.848178000         -0.000235000
C       -4.453371000         2.913503000         -0.000201000
C        1.076897000         5.213193000         -0.000256000
C       -0.133223000         5.321956000         -0.000283000
C        5.263650000         0.773035000         0.000091000
C       -5.253245000        -0.840646000         0.000009000
C26-opt.wfn
计算时卡着不动:
输出文件截图如下:

2.png (14.98 KB, 下载次数 Times of downloads: 25)

2.png

3.png (36.46 KB, 下载次数 Times of downloads: 33)

log文件

log文件

2.png (14.98 KB, 下载次数 Times of downloads: 23)

计算卡在L1不动

计算卡在L1不动

C26-opt.gjf

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-6-2 17:40:23 | 只看该作者 Only view this author
只计算opt或者只计算freq都卡在L101不动,计算单点可以正常结束

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发表于 Post on 2021-6-2 17:44:45 | 只看该作者 Only view this author
用#p,而非#,可以看到更多输出、计算过程,当前输出太少。没必要尝试Win版Gaussian,直接在linux下用g16算即可,接下来也无需再贴Win下的任何内容(因为没用)。你还得交待你的linux下所用的核数和内存,你不可能真的只用1个核在算啊,那当然是动不了了,体系和基组都不小。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-6-2 17:51:37 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2021-6-2 17:44
用#p,而非#,可以看到更多输出、计算过程,当前输出太少。没必要尝试Win版Gaussian,直接在linux下用g16算 ...

做过的尝试如下:
(1)换#p和#,
(2)换版本G09D01(Windows 4c,1.5G), G16a03(36c, 180G),
(3)换泛函m062x-wb97xd.
(4)单独计算opt,单独计算freq。
上述尝试都只停在L101.exe不动。但只跑单点,上述都可以~还请老师们指点

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发表于 Post on 2021-6-2 19:51:34 | 只看该作者 Only view this author
你先用#p看到底是停在什么步骤上了

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发表于 Post on 2021-6-2 20:08:09 | 只看该作者 Only view this author
liyunlu 发表于 2021-6-2 17:51
做过的尝试如下:
(1)换#p和#,
(2)换版本G09D01(Windows 4c,1.5G), G16a03(36c, 180G),

不用列很多种情况。直接给出#p下,linux下某个“卡住”的文件末尾截图。
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发表于 Post on 2021-6-3 07:10:10 | 只看该作者 Only view this author
没必要自己优化。我在这篇博文介绍的文章的补充材料里都已经提供好了<=C30的优化完的坐标了
揭示各种新奇的碳环体系的振动特征
http://sobereva.com/578http://bbs.keinsci.com/thread-20919-1-1.html

这和Gaussian对于某些高阶点群处理上的bug有关,之前我在上面这篇文章里提到的研究中算大环的时候就已经遇到了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-6-3 09:35:39 | 只看该作者 Only view this author
感谢各位老师的解答,这个的确与sob老师说的,可能是高阶对称性的问题,使用opt=z-matrix可以解决这个问题,就是让优化时使用内坐标进行计算(输入文件的坐标时内坐标还是笛卡尔坐标)

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