Gaussview对40个萘分子进行建模怎么实现？

落微 · 发表于 Post on 2021-6-29 10:32:22

各位老师好，请教一下，我看到有文章用MS中Amorphous Cell模块对40个萘分子进行建模然后带入到Lammps中进行计算；我想用Gauss view做这个建模过程，请问怎么实现吗？如果不能实现，请问有没有其他软件能做这个建模过程呢？

让你变成回忆 · 发表于 Post on 2021-6-29 10:48:12

packmol了解一下

naoki · 发表于 Post on 2021-6-29 15:47:07

gaussview不太行，楼上说的packmol是首选。看《分子动力学初始结构构建程序Packmol的使用》（http://bbs.keinsci.com/thread-12549-1-1.html）
MS的AC模块也行，AC比较僵硬，远不如packmol灵活，但它有个方便之处就是可以根据填充的数量计算所需立方体盒子的边长，省得自己根据密度算

落微 · 发表于 Post on 2021-6-29 16:56:10

让你变成回忆发表于 2021-6-29 10:48
packmol了解一下

收到，谢谢老师

落微 · 发表于 Post on 2021-6-29 16:58:37

naoki 发表于 2021-6-29 15:47
gaussview不太行，楼上说的packmol是首选。看《分子动力学初始结构构建程序Packmol的使用》（http://bbs.ke ...

收到，感谢，我去试试~

sobereva · 发表于 Post on 2021-6-29 21:46:55

如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并清楚反映出帖子具体内容，避免有任何歧义，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的严重不恰当标题“Gaussview建模”改了，以后务必注意，下次将扣分处理！

落微 · 发表于 Post on 2021-6-30 16:23:33

sobereva 发表于 2021-6-29 21:46
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此 ...

收到，感谢提醒

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[新手求助] Gaussview对40个萘分子进行建模怎么实现？

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