高斯计算柔性扫描过程没有出现预期的能量突降

HH@BUCT · 发表于 Post on 2021-7-15 23:54:51

本帖最后由 HH@BUCT 于 2021-7-16 00:06 编辑

大家好，我正在对一个罗丹明衍生物的体系使用B3LYP/6-31G(d,p)基组进行柔性扫描来模拟将如下所示的分子拉开环，理论上由于开环后形成大的共轭结构，应该会有一个能量的突降，但是在能量曲线上并没有出现，我在GaussView中看到的开环结构中也没有发现苯环和氧杂环共平面的现象，不清楚是什么原因导致没有优化到更稳定的共轭结构，希望得到大家的帮助。分子结构，开环结构（对应能量曲线中红色箭头所指），输入文件（中途报错一次，我减小步长继续计算，所以有两个文件），能量曲线如下

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-7-16 02:25:01

这个反应我感觉很可能需要有酸把酰胺质子化才能拉开。如果强行拉开，一边是氮负离子，一边是碳正离子，相互作用太强，所以能量一直上升，单是形成大共轭体系可能不足以导致能量下降

ZZU_SCU · 发表于 Post on 2021-7-16 09:18:08

建议在gjf文件中加上em=gd3bj

HH@BUCT · 发表于 Post on 2021-7-16 10:21:45

wzkchem5 发表于 2021-7-16 02:25
这个反应我感觉很可能需要有酸把酰胺质子化才能拉开。如果强行拉开，一边是氮负离子，一边是碳正离子，相互 ...

感谢回复，如果选择合适的极性溶剂环境，是否就有可能实现这样的过程呢？

HH@BUCT · 发表于 Post on 2021-7-16 10:28:13

ZZU_SCU 发表于 2021-7-16 09:18
建议在gjf文件中加上em=gd3bj

感谢回复，正在尝试

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-7-16 14:51:54

HH@BUCT 发表于 2021-7-16 03:21
感谢回复，如果选择合适的极性溶剂环境，是否就有可能实现这样的过程呢？

有可能，但即使是那样，和酰胺直接作用的那个溶剂分子也要显式描述

HH@BUCT · 发表于 Post on 2021-7-16 15:37:28

wzkchem5 发表于 2021-7-16 14:51
有可能，但即使是那样，和酰胺直接作用的那个溶剂分子也要显式描述

我明白您的意思了，正在尝试中，感谢回复。

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[Gaussian/gview] 高斯计算柔性扫描过程没有出现预期的能量突降

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