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[Dalton] dalton计算S1-T1的Spin-orbit matrix elements用S1还是T1结构?

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我做的是延迟荧光方向,用dalton计算 <S1|HSO|T1>坐标文件应该用S1态的下的还是T1态的,看文献上有人用的S1的,也有用T1的,不知道哪个才是合适的,求高手指点,谢谢了!

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发表于 Post on 2017-3-22 19:03:03 | 只看该作者 Only view this author
找S1和T1的MECP再计算SO矩阵元更有意义
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发表于 Post on 2017-3-22 19:31:40 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-22 19:03
找S1和T1的MECP再计算SO矩阵元更有意义

Sob老师 能否进一步解释一下用S1 T1 以及MECP结构各自的意义?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-23 08:12:16 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-22 19:03
找S1和T1的MECP再计算SO矩阵元更有意义

谢谢老师的回复,我算的是有机分子(不含金属原子)可以找MECP吗?可以的话怎么找呢?

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发表于 Post on 2017-3-23 10:09:39 | 只看该作者 Only view this author
叫我易小星 发表于 2017-3-23 08:12
谢谢老师的回复,我算的是有机分子(不含金属原子)可以找MECP吗?可以的话怎么找呢?

搜索一下“”使用MECP程序结合Gaussian程序搜索极小能量交叉点“”

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-23 14:46:17 | 只看该作者 Only view this author
wq8484 发表于 2017-3-23 10:09
搜索一下“”使用MECP程序结合Gaussian程序搜索极小能量交叉点“”

嗯嗯,非常感谢

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发表于 Post on 2017-3-23 15:53:28 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-22 19:03
找S1和T1的MECP再计算SO矩阵元更有意义

我看文献上一般算ISC 就用S1的geometry 算RISC 就用T1的geometry。 我就寻思。难道不是MECP点更加合理么? 哈哈,现在确定了。

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发表于 Post on 2021-8-5 16:03:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-22 19:03
找S1和T1的MECP再计算SO矩阵元更有意义

老师 您好 这里去找MECP的时候 初始结构用S1还是T1呢(ISC和RISC我都想去考察一下)
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发表于 Post on 2021-8-5 16:26:29 | 只看该作者 Only view this author
lyfchem 发表于 2021-8-5 09:03
老师 您好 这里去找MECP的时候 初始结构用S1还是T1呢(ISC和RISC我都想去考察一下)

都可以,选哪个只影响优化速度而不影响结果。个人觉得选其中能量较高的那个比较好,因为当S1和T1都有平衡结构的时候,MECP一般比两者都高,所以其中能量较高的那个和MECP结构应该更像

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Zikuan Wang
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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发表于 Post on 2021-8-5 22:40:01 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-8-5 16:26
都可以,选哪个只影响优化速度而不影响结果。个人觉得选其中能量较高的那个比较好,因为当S1和T1都有平衡 ...

老师,如果在模拟结构是从晶体结构里得到的,那么在计算激发态的时候还需要对结构做(限制性)优化吗?这个时候找MECP还有意义吗?在受激后,这种结构变化是不是不会太大?
I AM an Amphibious Warrior.

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发表于 Post on 2021-8-5 23:59:10 | 只看该作者 Only view this author
晓来雨过 发表于 2021-8-5 15:40
老师,如果在模拟结构是从晶体结构里得到的,那么在计算激发态的时候还需要对结构做(限制性)优化吗?这 ...

如果不管用什么方法优化,结构都和晶体结构定性不同,那么只优化氢原子,其他原子不优化。否则要优化,且除非有特殊原因,否则不要做限制。如果研究涉及激发态结构优化,那么基态结构也必须优化,因为这样才和激发态结构优化的理论级别一致。
MECP仍然可以找,找MECP是否有意义和初始结构无关。
不一定变化不大,起码永远不能近似为完全不变
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2021-8-6 12:54:42 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-8-5 23:59
如果不管用什么方法优化,结构都和晶体结构定性不同,那么只优化氢原子,其他原子不优化。否则要优化,且 ...

老师,如果用类似的方法去量化,说明其结构变化差异不大,那是不是说明可以做限制性优化来计算激发态的性质?
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发表于 Post on 2021-8-6 14:35:51 | 只看该作者 Only view this author
晓来雨过 发表于 2021-8-6 05:54
老师,如果用类似的方法去量化,说明其结构变化差异不大,那是不是说明可以做限制性优化来计算激发态的性 ...

你说的限制性优化指的是限制哪些自由度?
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2021-8-6 14:40:39 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-8-6 14:35
你说的限制性优化指的是限制哪些自由度?

冻结非氢原子的坐标
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发表于 Post on 2021-8-6 14:52:09 | 只看该作者 Only view this author
晓来雨过 发表于 2021-8-6 07:40
冻结非氢原子的坐标

不建议这么做。首先这个体系的激发态基本不涉及氢原子,所以冻结非氢原子和把氢原子也冻结在基态结构差不多。这样一来,你算出来的Stokes位移就基本为0了。一般来说,Stokes位移即使再小(哪怕只有十几nm)也是一个重要的现象,你用一个把Stokes位移近似成0的方法来做计算,一定会被质疑,届时你又得做一个不冻结的计算,证明Stokes位移确实很小,既然如此那不如一开始就不冻结。
如果要考虑晶体堆积力对激发态结构的影响,应该用QM/MM,而不要简单地把非氢原子冻结在晶体结构的位置。
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