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[新手求助] 计算高斯出现NB too large for integers on this machine问题

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楼主
log如下:
**** Warning!!: The largest alpha MO coefficient is  0.22162853D+02

Symmetrizing basis deriv contribution to polar:
IMax=3 JMax=2 DiffMx= 0.00D+00
G2DrvN: will do     9 centers at a time, making    1 passes.
Calling FoFCou, ICntrl=  3107 FMM=T I1Cent=   0 AccDes= 0.00D+00.
NB too large for integers on this machine.
Error termination via Lnk1e in G:\G16W\l1110.exe at Wed Sep 15 01:52:57 2021.
Job cpu time:       0 days  2 hours 36 minutes 50.0 seconds.
Elapsed time:       0 days  2 hours 36 minutes 39.8 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=  48040 Int=      0 D2E=      0 Chk=   4554 Scr=      1



我的gjf如下:
%mem=20GB
%chk=G:\G16W\e.chk
%CPU=0,1,2,3,4,5,6,7
# opt freq=anharmonic b3lyp/6-31g

Title Card Required

0 1
C                  0.00000000    0.00000000    0.00000000
C                  0.89000000    0.89000000    0.89000000
C                  0.00000000    1.78000000    1.78000000
C                  2.67000000    0.89000000    2.67000000
C                  1.78000000    0.00000000    1.78000000
C                  0.89000000    2.67000000    2.67000000
C                  1.78000000    1.78000000    0.00000000
C                  2.67000000    2.67000000    0.89000000
Tv                 3.56000000    0.00000000    0.00000000
Tv                 0.00000000    3.56000000    0.00000000
Tv                 0.00000000    0.00000000    3.56000000


我的完整最近的完整log如下:
https://paste.ubuntu.com/p/SnsWvDR6fq/

我的需求如下:
计算金刚石结构的C-14的结构优化和非谐振的计算,通过这样来计算C14的晶胞大小

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发表于 Post on 2021-9-15 15:28:01 | 只看该作者 Only view this author
Gaussian目前版本的PBC连谐振都做不了,还想做非谐振,根本不可能
而且6-31g这么垃圾的基组就算程序能给出结果又有何意义?哪怕你只是算非谐振校正量,这么烂的基组也绝对不可接受。太缺乏相关常识了
算晶胞尺寸直接对晶胞做优化就完了,根本不牵扯做振动分析
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2021-9-15 23:09:24 | 只看该作者 Only view this author
优化为啥要算非偕振?

随便找个QE/VASP/CASTEP之类的算PBC不香么?金刚石一个元胞就两个原子

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发表于 Post on 2021-9-16 11:27:11 | 只看该作者 Only view this author
周期性体系的freq是和孤立体系很不一样的,涉及到声子什么的(随便找本固体物理书看看就知道了),高斯现在还不能实现,更不用说算非谐了。
现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

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发表于 Post on 2021-11-24 00:21:12 | 只看该作者 Only view this author
                               
高斯的PBC频率计算有bug,以下是我刚琢磨出的凑合的解决方法。
高斯只能算PBC的数值频率,不能算解析频率。如果你只写freq,它就会傻乎乎地当成解析频率来算(猜测高斯看到计算要求的是纯泛函,心想:这还不简单,上解析二阶导数!然后就崩了。这是第一个bug。),所以你要写freq=numer。数值频率慢如乌龟,几乎没什么用。
注意这样一来它可能仍然不能正常结束(第二个bug),也不能输出热力学数据,不过可以在报错退出前输出振动模式了。
有了振动模式,喂给GaussView,仍然不能显示振动的动画,vibration那个按钮是灰色的(第三个bug)。你要手动改一改输出文件,才能观看振动。以下是修改后的输出文件,能正常显示振动动画。你可以照着这个文件来改自己的输出文件。(本来想把修改前的输出文件放上来,可是太大了,不让上传)
2rev.log (230.71 KB, 下载次数 Times of downloads: 11)

因为有这些bug,最好不要用高斯算PBC了。不过GaussView的PBC建模功能很给力。这里带点儿私货,推荐一下我弄的GaussView+PWscf的解决方案http://bbs.keinsci.com/thread-20166-1-1.html

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