如何构建由8个（111）面和6个（100）面组成的FCC晶格结构的Pt纳米粒子呢？

Hollytree · 发表于 Post on 2021-11-21 16:13:39

想要构建由8个（111）面和6个（100）面组成的FCC晶格结构的Pt纳米粒子，但是不知道用什么软件进行构建，如何构建，之前的建模多是采用material studio, 不知道Pt纳米粒子也可以用该软件构建吗？具体应该怎么操作呢？

卡开发发 · 发表于 Post on 2021-11-21 16:27:38

这个条件应该还算简单，Pt是FCC的，意味着6个面全是100或者其等价面，然后造个大格子去周期性，然后对8个顶点沿着体对角线截角就行了。你要随便给个条件估计就没法整了。

NK-MOF · 发表于 Post on 2021-11-21 21:08:15

可以用ASE，具体参考官方教程里构建Cu纳米颗粒的例子：https://wiki.fysik.dtu.dk/ase/ase/cluster/cluster.html

tjuptz · 发表于 Post on 2021-11-22 20:48:57

charmm-gui也可以构建Pt的Wulff construction和简单几何形状，不过看起来远没有ase灵活

wsz · 发表于 Post on 2021-11-23 03:14:16

1）构建一个足够大的超胞，然后calculate bond连上化学键；
2）选中一个原子，尽可能靠近中间；
3）Edit --> Atom Selection --> Connected (Add to the existing selection) --> Select:

（原子数1 --> 13 --> 55（约1 nm） --> 147（约1.5 nm） ...）
4) 复制，然后粘贴到一个空白的xsd文件即可。

Hollytree · 发表于 Post on 2021-11-26 09:26:16

wsz 发表于 2021-11-23 03:14
1）构建一个足够大的超胞，然后calculate bond连上化学键；
2）选中一个原子，尽可能靠近中间；
3）Edit ...

谢谢！

Hollytree · 发表于 Post on 2021-11-26 09:26:40

NK-MOF 发表于 2021-11-21 21:08
可以用ASE，具体参考官方教程里构建Cu纳米颗粒的例子：https://wiki.fysik.dtu.dk/ase/ase/cluster/cluster ...

谢谢！

Hollytree · 发表于 Post on 2021-11-26 09:27:09

tjuptz 发表于 2021-11-22 20:48
charmm-gui也可以构建Pt的Wulff construction和简单几何形状，不过看起来远没有ase灵活

谢谢！

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