计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 3825|回复 Reply: 6
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 计算H+在水的溶解自由能只有实验的一半

[复制链接 Copy URL]

341

帖子

0

威望

4571

eV
积分
4912

Level 6 (一方通行)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本帖最后由 archer 于 2021-12-10 20:38 编辑

M05-2X/6-31G* SMD溶剂为H2O,计算H+的能量结果为~-130kcal/mol,实验值为-264.61,为什么会出现这样大的差距?
H+是处理成单个的H+

200

帖子

1

威望

1325

eV
积分
1545

Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 2021-12-10 15:01:23 | 只看该作者 Only view this author
质子的热力学数据直接用实验值
计算小白 水平很菜
随时可喷 万望指点

1万

帖子

0

威望

9900

eV
积分
22154

Level 6 (一方通行)

3#
发表于 Post on 2021-12-10 15:40:13 | 只看该作者 Only view this author
H+是处理成了H+、H3O+还是H9O4+?
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

341

帖子

0

威望

4571

eV
积分
4912

Level 6 (一方通行)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-12-10 20:37:29 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-12-10 15:40
H+是处理成了H+、H3O+还是H9O4+?

H+是处理成单个的H+

1万

帖子

0

威望

9900

eV
积分
22154

Level 6 (一方通行)

5#
发表于 Post on 2021-12-10 23:22:37 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wzkchem5 于 2021-12-10 16:30 编辑
archer 发表于 2021-12-10 13:37
H+是处理成单个的H+

SMD不能处理裸的阳离子,阳离子第一配位层必须显式描述(但不和水分子配位、也不和水分子形成氢键的阳离子除外,比如[(CH3)4N]+;虽然和水形成氢键,但是氢键比较弱且和正电荷中心距离较远的体系,也不一定要显式描述水,比如[(CH3)3NCH2CH2OH]+)。另外某些负电荷比较多的阴离子(例如磷酸根),第一配位层也必须显式描述,但是同等条件下阳离子的问题更大
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

341

帖子

0

威望

4571

eV
积分
4912

Level 6 (一方通行)

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-12-10 23:25:14 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-12-10 23:22
SMD不能处理裸的阳离子,阳离子第一配位层必须显式描述。另外某些负电荷比较多的阴离子,第一配位层也必 ...

明白了,感谢回复。

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125208

管理员

公社社长

7#
发表于 Post on 2021-12-11 04:09:40 | 只看该作者 Only view this author
此问题我都专门说过,下文里搜“关于单原子离子的溶解自由能的计算 ”

谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327http://bbs.keinsci.com/thread-3345-1-1.html

模型就算再近似,想再省事,也至少得用H3O+来算

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +5 收起 理由
Reason
archer + 5 谢谢

查看全部评分 View all ratings

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-27 16:02 , Processed in 0.184968 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list