Gaussian优化复合物疑问

lijiayisjtu · 发表于 Post on 2018-5-14 09:26:25

用高斯有段时间，一直有两个计算上的疑问，想询问大家。
1：如何确定能量最低的复合物？比如A和B组成的AB反应复合物，改变结构后高斯都能收敛但能量有差异，比如优化TS结构，此TS为OH与Cl断键，与S成键（已跑IRC验证），但稍微改变OH，Cl或硫代磷酸酯基团的位置，优化后的TS结构，能量均有不同。
2：对于rea(直接优化反应物，做opt)和IRC-rea(取IRC曲线一端的反应物结构，再做opt),计算能垒时，是否为TS的吉布斯自由能减去IRC-rea的吉布斯自由能？

李海波 · 发表于 Post on 2019-10-15 14:01:37

请问一下，楼主的反应复合物和生成复合物是用IRC两端的优化出来的吗，我现在也在想怎么算能垒的问题，想问一下楼主怎么解决的

lijiayisjtu · 发表于 Post on 2019-10-15 19:36:01

李海波发表于 2019-10-15 14:01
请问一下，楼主的反应复合物和生成复合物是用IRC两端的优化出来的吗，我现在也在想怎么算能垒的问题，想问 ...

势能面是很复杂的，不同的初始结构，TS结构也不同，
对于决速步来说，是只有一个

李总把头 · 发表于 Post on 2021-4-6 21:52:04

您好楼主在使用Gaussian的时候优化复合物结构是怎么做到的呢方便讲一下么感谢

19835675021 · 发表于 Post on 2021-12-20 17:12:53

lijiayisjtu 发表于 2019-10-15 19:36
势能面是很复杂的，不同的初始结构，TS结构也不同，
对于决速步来说，是只有一个

由于初始结构的不同导致TS不同，请问楼主该如何选取反应前复合物和反应后复合物？

lijiayisjtu · 发表于 Post on 2021-12-20 19:35:54

19835675021 发表于 2021-12-20 17:12
由于初始结构的不同导致TS不同，请问楼主该如何选取反应前复合物和反应后复合物？

当时刚用Gaussian 遇到这样的问题，现在看这么选取：一个TS 走IRC 是有对应的产物和反应物的，能垒就根据这条IRC的算，不同起始结构对应的TS自然不同，所以选取时要保证反应物 TS 产物都是一一对应的

19835675021 · 发表于 Post on 2021-12-20 21:53:38

lijiayisjtu 发表于 2021-12-20 19:35
当时刚用Gaussian 遇到这样的问题，现在看这么选取：一个TS 走IRC 是有对应的产物和反应物的，能垒就根据 ...

楼主，那反应复合物指的是哪部分的结构？

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