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[新手求助] 关于弱相互作用大小的咨询

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各位老师,我研究了下分子内的弱相互作用,通过学习sob老师的博文,我了解到了RDG函数可以描述弱相互作用区域,如图
我的疑问是,我现在不清楚如何判断弱相互作用变化,两个区域的不同是:第二个分子的给体部分加入了两个乙基,谢谢各位老师给出建议

RDG.png (155.91 KB, 下载次数 Times of downloads: 40)

两分子的弱相互区域

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发表于 Post on 2017-3-26 16:30:24 | 只看该作者 Only view this author
加入乙基对电子结构影响是很弱的,反应到图中这种分子内很小区域的弱相互作用上,通过图形化分析上更是难以体现出来。即便你用一些能量分解方法来分析,预期也不会有多大改变
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-26 17:40:34 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-26 16:30
加入乙基对电子结构影响是很弱的,反应到图中这种分子内很小区域的弱相互作用上,通过图形化分析上更是难以 ...

谢谢sob老师,我看网上说弱相互作用是偶极偶极的作用,那么能不能用偶极矩的大小来表征弱相互作用的变化的,也就是说加了侧基后偶极大小发生了如何变化
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发表于 Post on 2017-3-26 17:47:48 | 只看该作者 Only view this author
三石草祭 发表于 2017-3-26 17:40
谢谢sob老师,我看网上说弱相互作用是偶极偶极的作用,那么能不能用偶极矩的大小来表征弱相互作用的变化 ...


这种说法明显不实。
弱相互的吸引部分分为静电作用和色散作用。色散作用姑且可以理解为瞬时偶极-瞬时偶极的作用,但注意是瞬时的而不是永久偶极间的作用,这来自于电子动态相关。至于静电作用部分,用永久偶极-永久偶极模型来描述,至少是对于当前体系,明显太不合适了,都没法给出定性正确的讨论。
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发表于 Post on 2017-3-26 17:54:51 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-26 17:47
这种说法明显不实。
弱相互的吸引部分分为静电作用和色散作用。色散作用姑且可以理解为瞬时偶极-瞬时 ...

咨询一下老师,一般这个分子间的距离多大还有pi-pi作用?我计算了一个,两个分子的平面之间是4.96埃,这个距离还有pi-pi吗?谢谢老师
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发表于 Post on 2017-3-26 18:04:57 | 只看该作者 Only view this author
小范范1989 发表于 2017-3-26 17:54
咨询一下老师,一般这个分子间的距离多大还有pi-pi作用?我计算了一个,两个分子的平面之间是4.96埃,这 ...

太远了。本身色散作用随距离呈1/r^6衰减,距离稍微一远,强度就很低了。你可以做个RDG图看看,如果连等值面都没有,更没法说pi-pi作用了。
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发表于 Post on 2017-3-27 07:39:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-26 18:04
太远了。本身色散作用随距离呈1/r^6衰减,距离稍微一远,强度就很低了。你可以做个RDG图看看,如果连等值 ...

偶,好的,谢谢sob老师。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-27 09:13:51 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-26 17:47
这种说法明显不实。
弱相互的吸引部分分为静电作用和色散作用。色散作用姑且可以理解为瞬时偶极-瞬时 ...

谢谢老师
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