求助：请问Amber可以使用两个力场吗？

xjw · 发表于 Post on 2022-3-18 19:45:27

我想做一个溶剂分子和锂盐的混合，利用Gaff力场得到了溶剂分子和锂盐阴离子的文件，但是最后却报错，tleap文件内容和报错信息如下：/home/xjw/software/amber20/bin/teLeap: Error!
For atom (.R<LI 202>.A<LI 1>) could not find vdW (or other) parameters for type (Li+)

sylar · 发表于 Post on 2022-3-18 21:54:33

加上source leaprc.ffPM3试试

rpestana94 · 发表于 Post on 2022-3-19 05:46:01

Try with source leaprc.water.fb3, it has Li parameters, you can check the parameters file in the Amber folder: "$AMBERHOME/dat/leap/ " inside there are cmd and parm folder which are parameter files you can use

xjw · 发表于 Post on 2022-3-19 08:16:57

sylar 发表于 2022-3-18 21:54
加上source leaprc.ffPM3试试

谢谢回复，我最后用source leaprc.ff99发现可以用

xjw · 发表于 Post on 2022-3-19 08:17:25

rpestana94 发表于 2022-3-19 05:46
Try with source leaprc.water.fb3, it has Li parameters, you can check the parameters file in the Amb ...

谢谢，我试试。我自己用leaprc.ff99可以使用

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