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[CASTEP/Dmol3/MS] 求助Materials studio中ONETEP模块计算团簇run那里显示灰色

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本帖最后由 南晓 于 2022-6-9 16:04 编辑

请问大家关于Materials studio中ONETEP模块了解吗,我建立了一个200多个原子的金属硫化物团簇,想用ONETEP模块进行计算,已经打开了团簇文件。可是run这里是灰色的请问大家知道这是怎么回事吗?

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发表于 Post on 2022-3-4 17:07:43 | 只看该作者 Only view this author
没装当然run不了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-4 17:39:25 | 只看该作者 Only view this author

我当时安装的时候是完整安装的,这是咋回事

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-4 17:42:09 | 只看该作者 Only view this author
南晓 发表于 2022-3-4 17:39
我当时安装的时候是完整安装的,这是咋回事

而且我建的晶体模型是可以点击run的,那个run就不是灰色的,计算团簇模型时就是灰色的。

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发表于 Post on 2022-3-4 17:47:11 | 只看该作者 Only view this author
南晓 发表于 2022-3-4 17:42
而且我建的晶体模型是可以点击run的,那个run就不是灰色的,计算团簇模型时就是灰色的。

周期性体系才能算
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-4 19:21:24 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-3-4 17:47
周期性体系才能算

您好我之前看到ONETEP可以计算大型催化剂团簇来着,它不可以算非周期性结构吗

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发表于 Post on 2022-3-4 19:22:55 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 卡开发发 于 2022-3-4 19:24 编辑
南晓 发表于 2022-3-4 19:21
您好我之前看到ONETEP可以计算大型催化剂团簇来着,它不可以算非周期性结构吗

需要加周期性边界,要取足够大的晶格参数来模拟非周期边界。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-4 20:51:57 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2022-3-4 19:22
需要加周期性边界,要取足够大的晶格参数来模拟非周期边界。

您好因为我以前只建立过团簇,您说的需要加周期性边界,要取足够大的晶格参数来模拟非周期边界。是说要给我建立的团簇加上周期性边界吗,后面取足够大的晶格参数来模拟非周期边界这个是为了什么,想请教请教,十分感谢!

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发表于 Post on 2022-3-4 22:38:08 | 只看该作者 Only view this author
南晓 发表于 2022-3-4 20:51
您好因为我以前只建立过团簇,您说的需要加周期性边界,要取足够大的晶格参数来模拟非周期边界。是说要给 ...

这个是基组和算法决定的,实际用的还是平面波基组(MS的help有ONETEP的background可以看看),周期性边界就被强制隐含于其中。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-5 09:11:12 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2022-3-4 22:38
这个是基组和算法决定的,实际用的还是平面波基组(MS的help有ONETEP的background可以看看),周期性边界 ...

好的感谢我去看看

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-5 16:35:33 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2022-3-4 22:38
这个是基组和算法决定的,实际用的还是平面波基组(MS的help有ONETEP的background可以看看),周期性边界 ...

您好我想到一个问题想再请教一下,我想探究的是催化剂团簇尺寸的敏感性,所以要建立不同尺寸的团簇来考察,由于每个团簇所含原子数较多,所以想在ONETEP这个模块里进行计算,您之前说要对团簇加周期性边界条件才能在ONETEP模块里来计算,请问如果我加上周期性边界条件以后,所建立几个模型还与尺寸有关吗,这个是不是就变成周期性结构了还能考察尺寸敏感性吗?我不太懂,想请教一下,多谢!

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发表于 Post on 2022-3-5 18:05:35 | 只看该作者 Only view this author
南晓 发表于 2022-3-5 16:35
您好我想到一个问题想再请教一下,我想探究的是催化剂团簇尺寸的敏感性,所以要建立不同尺寸的团簇来考察 ...

当周期边界趋近无穷大就退化到非周期边界了,所以上面强调是模拟非周期边界。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-5 20:07:33 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2022-3-5 18:05
当周期边界趋近无穷大就退化到非周期边界了,所以上面强调是模拟非周期边界。

请问这个意思是说我先建立周期性结构然后对这个周期性结构模拟非周期边界,请问是这样吗

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发表于 Post on 2022-3-5 21:59:16 | 只看该作者 Only view this author
南晓 发表于 2022-3-5 20:07
请问这个意思是说我先建立周期性结构然后对这个周期性结构模拟非周期边界,请问是这样吗

建模的时候就要考虑周期性边界,但是当周期性边界的晶格参数足够大的时候可以近似认为结果与非周期性的边界差异不大。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-6 15:24:44 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2022-3-5 21:59
建模的时候就要考虑周期性边界,但是当周期性边界的晶格参数足够大的时候可以近似认为结果与非周期性的边 ...

好的谢谢请问我可以用这种方法建立不同尺寸的团簇吗

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