关于molclus提供traj.xyz拆分计算的建议

ABetaCarw · 发表于 Post on 2022-7-22 18:18:58

本帖最后由 ABetaCarw 于 2022-7-22 19:03 编辑

我自己常用xtb做结构初筛计算，发现xtb在多核并行效率偏低，比如36核计算，不如9+9+9+9开四个xtb同时算。
我的建议如下
对于比如含有200个结构的traj.xyz文件，提供一个选项，将目前系统的核数（比如36核），拆分成0-8核计算1-50号结构，9-17计算51-100号结构，18-26计算101-150号结构，27-35计算151-200号结构
基本上可以同时计算结束，最大化利用系统资源。

虽然可以手动拆成4个traj.xyz文件开四个molclus窗口调用四个xtb，但肯定不如软件原生支持来得便捷。

丁越 · 发表于 Post on 2022-7-22 20:10:32

钟叔早已经把脚本写好啦（http://bbs.keinsci.com/thread-14361-1-1.html）

exity · 发表于 Post on 2022-7-23 11:55:19

不是有crest吗？

ABetaCarw · 发表于 Post on 2022-7-23 23:08:34

丁越发表于 2022-7-22 20:10
钟叔早已经把脚本写好啦（http://bbs.keinsci.com/thread-14361-1-1.html）

钟叔牛逼

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