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[新手求助] 求助:电子自旋密度怎么看

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我计算完out文件中的电子自旋密度结果和分子结构如图所示,想知道报告中的坐标是怎么对应结构中的原子的,是不是涉及软件其他查看功能最后想得到的结果形式如图三

微信截图_20220805162047.png (33.05 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)

结构

结构

微信截图_20220805162033.png (67.07 KB, 下载次数 Times of downloads: 5)

out文件数值

out文件数值

微信截图_20220805162057.png (25.45 KB, 下载次数 Times of downloads: 6)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-5 16:37:06 | 只看该作者 Only view this author

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发表于 Post on 2022-8-5 16:42:11 | 只看该作者 Only view this author

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-5 16:53:13 | 只看该作者 Only view this author
sylar 发表于 2022-8-5 16:42
http://sobereva.com/353

谢谢我看了链接内容但是,报告中的原子自旋布居和结构里的原子对应关系我有点不太会看,希望能详细告知,非常感谢!

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发表于 Post on 2022-8-5 18:23:05 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 QuantumicGuy 于 2022-8-6 09:47 编辑
Ace2333 发表于 2022-8-5 16:53
谢谢我看了链接内容但是,报告中的原子自旋布居和结构里的原子对应关系我有点不太会看,希望能详细告知, ...

GaussView打开含结构信息的文件,工具栏View-Labels就可以看到分子结构中原子的编号了。自旋密度图结合原子自旋布居一起分析比较好,自旋密度可以用Multiwfn导出spindensity.cub文件用VMD观看,自旋布居同样可以用Multiwfn输出Mulliken, Hirshfeld, Becke等的自旋布居分析,具体细节看楼上贴出的博文。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-5 23:24:57 | 只看该作者 Only view this author
QuantumicGuy 发表于 2022-8-5 18:23
GaussView打开含结构信息的文件,view-lable就可以看到分子结构中原子的编号了。自旋密度图结合原子自旋 ...

非常感谢!

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发表于 Post on 2022-8-6 03:31:07 | 只看该作者 Only view this author
Ace2333 发表于 2022-8-5 16:53
谢谢我看了链接内容但是,报告中的原子自旋布居和结构里的原子对应关系我有点不太会看,希望能详细告知, ...

好好把http://sobereva.com/353博文看了,说的没法更清楚
Atomic-Atomic spin densities对你根本毫无用处
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