计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 13471|回复 Reply: 8
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[VASP] VASP中晶胞优化出来c方向高度太低怎么办?

[复制链接 Copy URL]

156

帖子

0

威望

649

eV
积分
805

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本帖最后由 Q-Chembio-llg 于 2021-3-29 10:12 编辑

如题,最近打算做g-C3N4吸附的相关课题,但是在优化晶胞时优化出来c方向高度总是太小(到后来没办法了就把c的初始值设成了80,结果K取111优化出来的c=28,再用K=335优化出来的c就只有11.5了,显然做吸附就不够了),然后用的是实验室的服务器,所以也没办法改程序来使c方向不优化,所以想来求教大家有没有什么解决方案,谢谢大家!

10

帖子

0

威望

712

eV
积分
722

Level 4 (黑子)

2#
发表于 Post on 2021-3-29 11:26:36 | 只看该作者 Only view this author
可以固定C轴的位置 不用优化
http://blog.wangruixing.cn/2019/05/05/constr/

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125141

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2021-3-29 11:52:58 | 只看该作者 Only view this author
大概率是计算设置和模型不当,即便靠固定c轴表面上规避了问题,本质上还是错的。不给出具体计算细节别人没法判断具体是什么情况
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

156

帖子

0

威望

649

eV
积分
805

Level 4 (黑子)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-29 12:04:58 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-3-29 11:52
大概率是计算设置和模型不当,即便靠固定c轴表面上规避了问题,本质上还是错的。不给出具体计算细节别人没 ...

这个是我的POSCAR和INCAR文件,麻烦老师帮我检查检查,谢谢

POSCAR

3.44 KB, 下载次数 Times of downloads: 8

KPOINTS

43 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 3

INCAR

306 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 4

156

帖子

0

威望

649

eV
积分
805

Level 4 (黑子)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-29 12:17:26 | 只看该作者 Only view this author
kkyle 发表于 2021-3-29 11:26
可以固定C轴的位置 不用优化
http://blog.wangruixing.cn/2019/05/05/constr/

谢谢您的回复,不过我们用的是学校的服务器,这个里面提到的脚本插不进去,直接permission denied掉了

3809

帖子

3

威望

1万

eV
积分
20344

Level 6 (一方通行)

围观吃瓜群众

6#
发表于 Post on 2021-3-29 12:26:32 | 只看该作者 Only view this author
(大部分第一原理程序的处理方式)二维体系要固定c轴,2楼的说法没问题。那个不算是脚本,而是改了源码,需要重新编译,你应该能够用个人账户去编译自己的版本。
日常打哑谜&&探寻更多可能。
原理问题不公开讨论,非商业性质讨论欢迎私聊。不做培*,不接代*,不接*发谢谢。

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125141

管理员

公社社长

7#
发表于 Post on 2021-3-29 18:00:08 | 只看该作者 Only view this author
Q-Chembio-llg 发表于 2021-3-29 12:04
这个是我的POSCAR和INCAR文件,麻烦老师帮我检查检查,谢谢

这种在真空区吸附的情况,要么按上面说的改源码,要么就先变胞优化g-C3N4自身,在合理设置下优化出来是多少就设多少,之后再在z方向设足够大的真空区,把小分子放上去,接下来的吸附结构的优化就不要求变胞了。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

156

帖子

0

威望

649

eV
积分
805

Level 4 (黑子)

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-29 18:19:52 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-3-29 18:00
这种在真空区吸附的情况,要么按上面说的改源码,要么就先变胞优化g-C3N4自身,在合理设置下优化出来是多 ...

好的,感谢sob老师答疑!

23

帖子

0

威望

243

eV
积分
266

Level 3 能力者

9#
发表于 Post on 2024-8-28 13:03:54 | 只看该作者 Only view this author
kkyle 发表于 2021-3-29 11:26
可以固定C轴的位置 不用优化
http://blog.wangruixing.cn/2019/05/05/constr/

请教大佬,固定c轴优化,原子位置是不是也在c轴方向上不优化啊?

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-22 05:43 , Processed in 0.201504 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list