配体的itp文件中charge项全为0，会对GROMACS蛋白配体模拟结果有何影响？

kopertqqq

    本人在做蛋白配体在水中的模拟，整个模拟过程也顺利跑完了，在检查配体itp文件发现，其中charge项全为0，请问这样会对影响模拟结果的可靠性吗，可以通过什么方法计算电荷。谢谢各位老师和朋友们。

sobereva

显然得自己计算原子电荷
诸如sobtop的教程http://sobereva.com/soft/Sobtop里都明确说了，里面搜 原子电荷

大量相关博文：
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http://sobereva.com/585（http://bbs.keinsci.com/thread-21462-1-1.html）

charge都为0相当于此分子和其它分子之间没有静电相互作用，明显计算没有意义

kopertqqq

sobereva 发表于 2022-8-30 18:38
显然得自己计算原子电荷
诸如sobtop的教程http://sobereva.com/soft/Sobtop里都明确说了，里面搜 原子电荷 ...

我明白了，谢谢sob老师