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[VASP] 怎么确定自己的过渡态是正确的呢?有一个虚频是正常的吗?

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有审稿人问,怎么确定自己的过渡态是正确的呢?我算了过渡态的虚频,请问这样的过渡态有一个虚频是正常的吗?如果不正常是大小不对吗?应该怎么解决呢?

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所念皆星河

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发表于 Post on 2022-9-13 19:25:51 | 只看该作者 Only view this author
确保找到的过渡态正确应同时满足三个条件:
1)有且仅有一个虚频
2)虚频波数>=100cm^-1
3)虚频对应的振动方向连接反应物与产物结构
心之所向,日复一日,必有精进

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#未来可寄

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发表于 Post on 2022-9-13 19:43:46 | 只看该作者 Only view this author
含光君 发表于 2022-9-13 19:25
确保找到的过渡态正确应同时满足三个条件:
1)有且仅有一个虚频
2)虚频波数>=100cm^-1

2)针对的是化学反应的过渡态吧

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发表于 Post on 2022-9-13 20:07:36 | 只看该作者 Only view this author
势垒极低的化学反应的过渡态也有波数小于100 cm^-1。所以始终强烈不建议拿波数大小作为判据
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2022-9-13 20:07:57 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “过渡态虚频” 改了,以后务必注意,下次将删帖+扣分处理
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2022-9-14 10:32:46 | 只看该作者 Only view this author
含光君 发表于 2022-9-13 19:25
确保找到的过渡态正确应同时满足三个条件:
1)有且仅有一个虚频
2)虚频波数>=100cm^-1

1和3满足就好了,jmol可视化一下频率振动方向是不是从初态到终态即可。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-9-15 15:08:44 | 只看该作者 Only view this author
含光君 发表于 2022-9-13 19:25
确保找到的过渡态正确应同时满足三个条件:
1)有且仅有一个虚频
2)虚频波数>=100cm^-1

好哒,谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-9-15 15:09:11 | 只看该作者 Only view this author
Daisy_zju 发表于 2022-9-14 10:32
1和3满足就好了,jmol可视化一下频率振动方向是不是从初态到终态即可。

哦哦,好的,谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-9-15 15:10:08 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-9-13 20:07
势垒极低的化学反应的过渡态也有波数小于100 cm^-1。所以始终强烈不建议拿波数大小作为判据

好的,那请问有了两个虚频怎么消除呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-9-15 15:10:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-9-13 20:07
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此 ...

好的,下次会注意的

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发表于 Post on 2022-9-15 15:36:38 | 只看该作者 Only view this author
chen0201 发表于 2022-9-15 08:10
好的,那请问有了两个虚频怎么消除呢?

http://sobereva.com/278的方法。这篇文章讲的是高斯,但是VASP以及其他所有软件都是一样的道理
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-9-16 15:09:50 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-9-15 15:36
按http://sobereva.com/278的方法。这篇文章讲的是高斯,但是VASP以及其他所有软件都是一样的道理

好哒,十分感谢

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