高斯09 E01版本无太明显的改进

lao7

今天收到高斯公司邮寄的G09 E.01版本，看看和D01的不同之处，好像没有太大差别。和当初大家一起讨论的有所出入。其中，好像第4项，对激发态计算有所改进，好像进步不大，懂的给解释解释，这些改进能解决哪些问题？不翻译了，大家直接看吧。

*Feature and Usage notes: Rev E.01 This revision is primarily to fix a variety of bugs reported by users or which were uncovered by the example jobs for the 3rd edition ofExploring Chemistry with Electronic Structure Methods.
♦ Formatted checkpoint files now include the version of G09 used and also a job status flag, so that GUIs can determine whether ajob is still running, failed or completed successfully. The number of imaginary frequencies is also included for frequency jobs.
♦ EOMCC=ListWindow now reads the window only once instead of twice.
♦ Rigid (unrelaxed) scans with large energies now generate a table of relative energies rather than ****’s.
♦ The TDHF excited states method now defaults to using the MO basis, the same default as for CIS.
♦ A fix for the reference atoms used in Hirshfeld charges will change the reported charges slightly.
♦ The overhead in using Linda parallelism with ECPs was removed.
♦ The build procedures include compiling natively for Sandybridge (AVX) x86_64 processors, including an AVX-enabled ATLASlibrary. A Sandybridge/Haswell binary distribution is also available.
♦ The divide-and-conquer diagonalization and SVD routines work in a larger fraction of cases.

sobereva

关于第四项：
CIS在g09中有三种方式处理积分，direct,MO,AO。默认是MO，先要做积分变换并储存到硬盘上，速度和资源瓶颈主要在积分读写和积分储存，之后迭代求解CI矩阵就很快了。AO是完全不储存MO积分，而是在迭代过程中每次用到MO积分的时候重新算AO，这样虽然比起SCF无任何额外资源消耗，但是迭代过程极慢。direct是介于二者中间，每次迭代也重算积分，但也储存一部分，所以迭代慢，但比AO快得多得多。如果硬盘又快又有地方，MO总耗时最低；如果硬盘不够或者慢，用direct是最好选择。
TD就是用direct方式做的，没有其它可选余地。E.01看样子把TDHF也改成和CIS一样默认用MO了。

lao7

sobereva 发表于 2016-2-23 16:51
关于第四项：
CIS在g09中有三种方式处理积分，direct,MO,AO。默认是MO，先要做积分变换并储存到硬盘上，速 ...

看来,除了支持AVX加速，其他好像没有明显改进的地方，而且AVX所谓的加速，还不知道效果咋样

sobereva

lao7 发表于 2016-2-23 17:42
看来,除了支持AVX加速，其他好像没有明显改进的地方，而且AVX所谓的加速，还不知道效果咋样

应该会有能察觉得到的提升，这点是有意义的改进

smutao

divide-and-conquer diagonalization
尝试一下调用他源码里面的对角化subroutine做个测试看看
D里面对角化只能单线程做，也就是说100%.

lao7

smutao 发表于 2016-2-23 22:08
divide-and-conquer diagonalization
尝试一下调用他源码里面的对角化subroutine做个测试看看
D里面对 ...

谢谢！光盘版G09E01本还没有安装过, 现在用的是G09D01版本。G09D01版本是盗版，知道如何安装，光盘版没有安装光驱，不知道能不能拷贝出来，像盗版一样安装？

lao7

lao7 发表于 2016-2-24 09:20
谢谢！光盘版G09E01本还没有安装过, 现在用的是G09D01版本。G09D01版本是盗版，知道如何安装，光盘版没有 ...

PS：加压之后直接覆盖。

smutao

lao7 发表于 2016-2-24 09:21
PS：加压之后直接覆盖。

你买的可能是binary版本 不是代码版

lastzealot

sob不是说过吗，e01中DFT-D3(BJ)在计算频率时比d01有加强嘛

http://sobereva.com/210
注意G09 D.01版D3(BJ)计算频率时色散校正的贡献是不完全准确的，因为忽略掉了依赖于r^-8的那项。对于力常数较大（较硬）的振动模式这个问题的影响可忽略，但对于力常数较小（较软）的振动模式就会造成一定误差，往往会导致虚频的出现（即便优化后已经准确处在极小点位置了）。但是零阻尼没有这个问题，所以G09 D.01的用户如果要算频率的话，还是在零阻尼下优化为宜。不过D3(BJ)的这个问题在G09 E.01版已经得到了修正。

lao7

smutao 发表于 2016-2-24 22:02
你买的可能是binary版本 不是代码版

对头，当时想买代码，不过想想买了也没有用，自己还要花时间编译，还要和高斯公司打报告批准，挺麻烦！

bluewhale

lao7 发表于 2016-2-24 09:20
谢谢！光盘版G09E01本还没有安装过, 现在用的是G09D01版本。G09D01版本是盗版，知道如何安装，光盘版没有 ...

不知是哪个组购买了e01? 我们正准备升级。

lao7

bluewhale 发表于 2016-3-7 15:39
不知是哪个组购买了e01? 我们正准备升级。

我的组买的，现在机器在运行，没有安装， 目前用的还是D01版本。

flour_wheat

有哪位大侠从G09 D01直接到G16吗？这种算升级，还是重新买？
另外，出了G16以后，还有可能从G09 D01升级到G09 E01吗？
如果G16需要重新购买，就不如升级到E01了。

sobereva

flour_wheat 发表于 2018-1-24 09:42
有哪位大侠从G09 D01直接到G16吗？这种算升级，还是重新买？
另外，出了G16以后，还有可能从G09 D01升级到 ...

算大升级（换句话说，是以优惠价购买G16）
应该不行，G09都已经不卖了

flour_wheat

sobereva 发表于 2018-1-24 11:49
算大升级（换句话说，是以优惠价购买G16）
应该不行，G09都已经不卖了

谢了！之前B01升到D01只花了1600RMB。不知道这种大升级会是什么情况。如果价钱太贵就还用D01算了。
主要是受不了D01那些BUG。
人家微软的补丁都是免费的。