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[Gaussian/gview] 优化碳纳米管160个碳原子,一直报错

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发表于 Post on 2019-5-2 14:36:41 | 只看该作者 Only view this author
增大SCFCYC循环次数试试

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-2 14:38:29 | 只看该作者 Only view this author
granvia 发表于 2019-5-2 14:36
增大SCFCYC循环次数试试

好的,我试一下,谢谢

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发表于 Post on 2019-5-2 14:42:50 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
shine 发表于 2019-5-2 14:38
好的,我试一下,谢谢

不知道你的模型是两段加帽的碳管还是开口碳管?如是后者,必须用氢原子消除两端碳原子的悬键

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-2 14:44:07 | 只看该作者 Only view this author
granvia 发表于 2019-5-2 14:42
不知道你的模型是两段加帽的碳管还是开口碳管?如是后者,必须用氢原子消除两端碳原子的悬键

是开口碳管,用两端的碳原子用氢原子连接的

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发表于 Post on 2019-5-2 15:12:19 | 只看该作者 Only view this author
不怎么用G,这问题能用PBC玩儿么?

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发表于 Post on 2019-5-2 16:07:14 | 只看该作者 Only view this author
仔细看
解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61
绝对不要盲目增加SCF迭代次数,奏效几率极低,反倒还容易因此白浪费时间,博文里明确强调了。

用PBE算这种体系毫无好处,还容易招质疑。改用常用的B3LYP,还更容易SCF收敛。
几何优化别把SCF收敛限放宽。你这种体系只要结构没有什么硬伤,用B3LYP算,SCF收敛根本没有什么难的。

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2019-5-2 16:34:38 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-5-2 16:07
仔细看
解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61

得看具体情况。就lz这个问题,应看下SCF每步能量变化走向,如果能量一直降低有收敛趋势,可以提到SCF循环次数。 另外,对于碳管这种经典成键体系,甚至可先用半经验方法取得较合理初猜几何构型,然后再用DFT优化。绝大多数SCF不收敛都是因初始几何构型不合理导致的

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发表于 Post on 2019-5-2 17:05:50 | 只看该作者 Only view this author
granvia 发表于 2019-5-2 16:34
得看具体情况。就lz这个问题,应看下SCF每步能量变化走向,如果能量一直降低有收敛趋势,可以提到SCF循环 ...

然而lz在提问时并没有体现出能量变化趋势(实际上从仅有的信息"Convg"的数值来看,即RMSDP,离默认的收敛限还有三个数量级),所以没有前提就鼓励使用解决SCF不收敛奏效几率最低的方法是不妥的。我的博文里也明确说了,只有看能量变化趋势,有收敛的苗头才适合增大迭代次数上限,所以我特意提及了不要“盲目”增大
仅当你观察迭代过程能量变化,发现随着迭代能量有缓慢降低,超过128步后继续迭代下去有希望收敛,才有必要加大循环次数上限,但极少会有这种情况出现。

关于几何结构不合理导致SCF难收敛这点的考虑,在我的博文里已经充分提及了
对于手动搭建的初始结构(往往结构偏离极小点较大),若使用某种想用的理论方法优化结构过程中出现SCF难收敛问题,除了使用有助于收敛的关键词、临时降低SCF标准外,也可以尝试先用其它对当前体系也基本合理的理论方法预优化(如使用半经验、用xtb程序做GFN-xTB),然后再改用实际要用的理论方法进一步优化,此时SCF不收敛的几率往往会减小很多。这方面更多的讨论看http://bbs.keinsci.com/thread-12578-1-1.html#pid86217

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发表于 Post on 2019-5-2 20:03:49 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-5-2 17:05
然而lz在提问时并没有体现出能量变化趋势(实际上从仅有的信息"Convg"的数值来看,即RMSDP,离默认的收敛 ...

有理有据。我错了

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发表于 Post on 2019-5-2 21:54:43 | 只看该作者 Only view this author
granvia 发表于 2019-5-2 20:03
有理有据。我错了

学术讨论,这局讨论没什么对错,作为旁观者,看到的是“理越辩越明”
恍惚月余,深谙人与人之间的差距。以后还应努力学习,才能与强者比肩。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-3 12:58:28 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-5-2 16:07
仔细看
解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61

好的,非常感谢

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发表于 Post on 2022-10-14 14:43:11 | 只看该作者 Only view this author
granvia 发表于 2019-5-2 14:42
不知道你的模型是两段加帽的碳管还是开口碳管?如是后者,必须用氢原子消除两端碳原子的悬键

请问老师,开口碳管为什么一定要加氢,我看过一篇文章做过不加氢的碳管的几何优化和振动分析,我打算重复他的工作。

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发表于 Post on 2022-10-14 15:21:44 | 只看该作者 Only view this author
RES 发表于 2022-10-14 07:43
请问老师,开口碳管为什么一定要加氢,我看过一篇文章做过不加氢的碳管的几何优化和振动分析,我打算重复 ...

因为不加氢的开口碳管实验上很难做出来,算不加氢的开口碳管的实际意义不大。即使实验上能做出来(比如把不开口的碳管掰断,或者用plasma打断),断口的结构也会重构,需要对断口做退火才能算,直接画个没饱和的zigzag或armchair边缘估计也不符合实际情况。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2022-10-14 16:14:26 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-10-14 15:21
因为不加氢的开口碳管实验上很难做出来,算不加氢的开口碳管的实际意义不大。即使实验上能做出来(比如把 ...

多谢老师

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