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[Molclus] 关于Molclus运行的问题

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请问我的Molclus在运行时,一直显示Gaussian正在计算,但是一直在算第一个构型(也就三个原子)。现在是搞不清是计算太慢还是我设置的问题,设置文件里面Gaussian路径我设置了,但是我没有设置电脑的环境变量。

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发表于 Post on 2022-6-27 20:59:03 | 只看该作者 Only view this author
明显settings.ini设置有错,屏幕提示很明显。认真看卢老师博文使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索里面的红字,特意用红字标出来的。
注意:如果是Windows版Gaussian,gaussian_path必须指向诸如g09.exe而不能是g09w.exe,因为后者只是前者的一个图形界面而已。

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发表于 Post on 2022-6-27 20:59:10 | 只看该作者 Only view this author
又是这种老生常谈的问题,红字都不看
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html


北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-28 10:36:54 | 只看该作者 Only view this author
snljty2 发表于 2022-6-27 20:59
明显settings.ini设置有错,屏幕提示很明显。认真看卢老师博文使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜 ...

谢谢,改过来了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-28 10:39:52 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-6-27 20:59
又是这种老生常谈的问题,红字都不看
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci. ...

谢谢sobereva老师,我都修改了,能调用高斯算,但是最后算成功了之后,isomers的文件还是空的

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发表于 Post on 2022-6-29 01:36:45 | 只看该作者 Only view this author
Drunkenfairy 发表于 2022-6-28 10:39
谢谢sobereva老师,我都修改了,能调用高斯算,但是最后算成功了之后,isomers的文件还是空的

molclus运行过程中在屏幕上给出非常详细的提示,仔细看屏幕上的内容判断,看不懂就把信息贴出来
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-29 10:44:42 | 只看该作者 Only view this author
好的,已经解决,是计算的问题

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发表于 Post on 2022-10-12 08:36:40 | 只看该作者 Only view this author
想请教一下各位,在使用molclus长时间运行的时候,放在后台运行或者电脑息屏了的时候,程序计算完一个构象后不会自动跳转到下一个构象,需要用鼠标点一下软件的运行界面,才会跳转下一个构象计算。本来想着晚上让它自己跑7个构象的结构优化的,早上来看发现还在第一个,任务管理器显示CPU没有被占用,应该是算完了的,但是没有跳到第二个,于是我双击一下软件的最上面的白框,放大界面后,软件就自动跳转下一个了,上一个构象显示优化时间是35495s。
想问一下大家有没有遇到这种情况,如何解决不会自动跳转下一个构象的问题。谢谢!

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发表于 Post on 2022-10-12 08:51:22 | 只看该作者 Only view this author
我这个分子,一般来说优化只要半个小时左右的。如下图所示,就是双击最上方的白边,作用是放大窗口,它就自动跳转第二个构象了,不然就一直卡在第一个。

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发表于 Post on 2022-10-12 15:50:20 | 只看该作者 Only view this author
viycole 发表于 2022-10-12 08:36
想请教一下各位,在使用molclus长时间运行的时候,放在后台运行或者电脑息屏了的时候,程序计算完一个构象 ...

cmd窗口开启快速编辑模式时(win10默认开启),不要点击窗口里面,否则会进入编辑模式,导致计算中断
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发表于 Post on 2022-10-12 16:03:44 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-10-12 15:50
cmd窗口开启快速编辑模式时(win10默认开启),不要点击窗口里面,否则会进入编辑模式,导致计算中断

好的谢谢老师,我注意一下看看情况!

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发表于 Post on 2022-10-18 07:57:44 | 只看该作者 Only view this author
怎么判断用molclus运行时,使用了CPU的几个核心数?Gaussian的default.rou里面已经设置了6个核心数。

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