MOLPRO CASSCF(7,5)/cc-pvdz优化结构计算太慢

baobao123 · 发表于 Post on 2023-2-21 17:48:21

MOLPRO的CASSCF（7,5)/cc-pvdz方法优化一个结构大概十个重原子，用了15核，每核1G内存，为什么每次七八个小时才算这么一点

zjxitcc · 发表于 Post on 2023-2-21 18:33:11

展示一下你提交molpro完整命令行参数；展示
echo $OMP_NUM_THREADS
echo $MKL_NUM_THREADS
运行结果。
综合上述结果，运行top，看看是不是开启了MPI和OpenMP混合并行，并超过了机器物理核数导致变慢。

baobao123 · 发表于 Post on 2023-2-21 19:15:16

zjxitcc 发表于 2023-2-21 18:33
展示一下你提交molpro完整命令行参数；展示
echo $OMP_NUM_THREADS
echo $MKL_NUM_THREADS

老师您好，这个是我运行时候的参数，您看有啥问题吗

zjxitcc · 发表于 Post on 2023-2-21 19:24:56

你现在估计是以15*12核在跑（MPI和OpenMP混合并行），互相挤占资源，肯定非常慢。如果机器物理核心数只有15，那要用molpro -n 15 -t 1 -m ...只使用MPI并行，不使用OpenMP并行。

baobao123 · 发表于 Post on 2023-2-21 19:58:52

zjxitcc 发表于 2023-2-21 19:24
你现在估计是以15*12核在跑（MPI和OpenMP混合并行），互相挤占资源，肯定非常慢。如果机器物理核心数只有15 ...

老师我的机器一共32核，现在是180核心在跑吗，我试下您说的方法

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[Molpro] MOLPRO CASSCF(7,5)/cc-pvdz优化结构计算太慢