求助，vmd中怎么让水分子以单个球形呈现

Layman · 发表于 Post on 2024-9-10 21:14:46

各位老师好，请问一下，在vmd中，如何设置可以将水/冰分子用一个球体来展示，以求达到图示效果

Loading0760 · 发表于 Post on 2024-9-10 22:12:26

在select atoms里试试这种语法
water and name "O."
可以选中所有的水分子中的氧原子，再调整显示样式估计可以实现

Dempey · 发表于 Post on 2024-9-10 22:25:19

Drawing Method中选择Beads或许可以达到这种效果

Layman · 发表于 Post on 2024-9-11 10:13:49

Loading0760 发表于 2024-9-10 22:12
在select atoms里试试这种语法
water and name "O."
可以选中所有的水分子中的氧原子，再调整显示样式估 ...

谢谢老师，以氧原子来展示可以达到类似的效果

Layman · 发表于 Post on 2024-9-11 10:15:31

Dempey 发表于 2024-9-10 22:25
Drawing Method中选择Beads或许可以达到这种效果

谢谢老师，选用beads结冰部分可以达到类似效果，但是对水分子的展示效果不如直接用氧原子来描述

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[VMD] 求助，vmd中怎么让水分子以单个球形呈现