求助学校平台计算的B3LYP/6-31G（d）几何优化没有log文件生成，请问为什么

27℃ · 发表于 Post on 2022-11-6 23:49:08

求助学校平台计算的B3LYP/6-31G（d）几何优化，一开始也生成编码了，已经运行20多小时了，但就是没有log文件生成，为什么？请各位老师指教
gif文件开始的程序如下：
%mem=10GB
%chk=HMF1.chk
# opt b3lyp/6-31g(d) scrf=(solvent=dichloroethane) em=gd3

谢谢老师

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-11-7 00:33:52

先跑一个特别小的分子（比如水分子），不指定%mem，看看是否也有类似问题

27℃ · 发表于 Post on 2022-11-7 00:52:07

wzkchem5 发表于 2022-11-7 00:33
先跑一个特别小的分子（比如水分子），不指定%mem，看看是否也有类似问题

老师，我看了是就没有开始，目前还没找出来为什么没算的原因

zjxitcc · 发表于 Post on 2022-11-7 01:01:12

你是不是使用脚本提交任务，然后脚本里把相关计算文件复制到另一个目录去算（有的集群的提交任务脚本是这样），但是忘记把log/out文件复制回来了？

27℃ · 发表于 Post on 2022-11-7 01:05:20

zjxitcc 发表于 2022-11-7 01:01
你是不是使用脚本提交任务，然后脚本里把相关计算文件复制到另一个目录去算（有的集群的提交任务脚本是这样 ...

刚才我又用小分子试了一下，还是不算，是不是我的色散程序不对，请老师解惑
程序如下：
%mem=10GB
%chk=X.chk
# opt b3lyp/6-31g(d) scrf=(solvent=dichloroethane) em=gd3

X

0 1
C                -2.36280000 -0.23820000 0.00010000
C                -2.41260000 -1.57790000 0.00000000
C                -1.26990000 -2.27920000 0.00000000
C                -0.08630000 -1.64480000 0.00000000
C                -0.02130000 -0.29820000 0.00010000
C                -1.17800000 0.39340000 0.00010000
C                1.17450000 0.36800000 0.00010000
O                1.20830000 1.74290000 0.00010000
C                2.46030000 2.38800000 0.00000000
O                2.22420000 -0.24660000 0.00010000
H                -3.29990000 0.34400000 0.00010000
H                -3.38480000 -2.09850000 0.00000000
H                -1.30610000 -3.38190000 0.00000000
H                0.81750000 -2.27640000 0.00000000
H                -1.19560000 1.49610000 0.00010000
H                2.27780000 3.48600000 -0.00010000
H                3.02960000 2.12340000 0.91900000
H                3.02950000 2.12330000 -0.91910000

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-11-7 01:36:18

27℃ 发表于 2022-11-6 18:05
刚才我又用小分子试了一下，还是不算，是不是我的色散程序不对，请老师解惑
程序如下：
%mem=10GB

色散校正有没有问题，自己删掉色散校正的关键词再跑一遍就知道了。
能通过自己试就能知道的问题，尽量不要问人。要有把问题事先自行简化再问人的能力

snljty2 · 发表于 Post on 2022-11-7 09:55:11

而且你这么写，没加%NProcShared或者%CPU，也没加其他的默认设置，是单核算。

北大-陶豫 · 发表于 Post on 2022-11-7 11:06:41

那有 .com 或者其它扩展名的文件吗

abdoman · 发表于 Post on 2022-11-7 14:18:34

怎么投的任务，计算的命令是什么？
输入文件对不对，不影响计算输出。错误的文件也有输出。

唐小梅 · 发表于 Post on 2022-11-8 18:50:13

我也和你有一样的问题，没有log文件。请问你解决了吗

唐小梅 · 发表于 Post on 2022-11-9 17:15:16

真的很急

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-11-9 17:26:20

唐小梅发表于 2022-11-8 11:50
我也和你有一样的问题，没有log文件。请问你解决了吗

要是真急就不要干等楼主回复，先按2楼的方法试

GoldenBaby · 发表于 Post on 2022-11-9 17:34:41

唐小梅发表于 2022-11-9 17:15
真的很急

这种情况一般不是应该直接找平台的管理员吗？指导你使用本身就是他们的工作，别自己瞎鼓捣了，浪费时间。

唐小梅 · 发表于 Post on 2022-11-9 19:22:42

GoldenBaby 发表于 2022-11-9 17:34
这种情况一般不是应该直接找平台的管理员吗？指导你使用本身就是他们的工作，别自己瞎鼓捣了，浪费时间。

哪个平台的管理员啊

唐小梅 · 发表于 Post on 2022-11-9 19:23:29

wzkchem5 发表于 2022-11-9 17:26
要是真急就不要干等楼主回复，先按2楼的方法试

已经试过了，还是没有办法

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