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[综合交流] 做N掺杂石墨烯吸附PMS,但是石墨N位点吸不上去

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楼主
请教各位大佬 最近在做N掺杂石墨烯吸附PMS,但是石墨N位点吸不上去,有人说N和PMS的O都带负电是不能吸附的,但又有很多文献说是形成了N-O键。想请问一下,这种情况能不能吸附呢,机理又是什么?还有就是,如果能吸附的话,我做出来的模型是哪里出了问题,因为我把PMS放在氮位点上它会自己跑掉。(模型在附件)

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发表于 Post on 2022-8-27 18:04:37 | 只看该作者 Only view this author
N掺杂石墨的方式有很多种,可能有的情况不能吸附,另一些情况能吸附。你建的模型和文献建的模型是一样的吗?
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-27 18:11:10 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-8-27 18:04
N掺杂石墨的方式有很多种,可能有的情况不能吸附,另一些情况能吸附。你建的模型和文献建的模型是一样的吗 ...

您好 我建的模型和文献基本一样,只是多了几个苯环,应该影响不大,也有可能是环境影响。有说石墨氮原子和PMS的O都带负电,所以氮和O不能成键,这个您怎么看 求教

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-27 18:14:57 | 只看该作者 Only view this author
REELM 发表于 2022-8-27 18:11
您好 我建的模型和文献基本一样,只是多了几个苯环,应该影响不大,也有可能是环境影响。有说石墨氮原子 ...

这个是我参考文献的模型

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发表于 Post on 2022-8-28 03:12:11 | 只看该作者 Only view this author
REELM 发表于 2022-8-27 11:11
您好 我建的模型和文献基本一样,只是多了几个苯环,应该影响不大,也有可能是环境影响。有说石墨氮原子 ...

多了几个苯环可能会影响体系的自旋多重度,比如有可能文献的氮杂石墨烯是开壳层的,而且自由基在氮上,所以容易和吸附质成键;你的氮杂石墨烯是闭壳层的,所以氮和吸附质的作用要弱很多
Zikuan Wang
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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发表于 Post on 2022-8-28 10:01:26 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “N掺杂石墨烯” 改了,以后务必注意,下次将删帖+扣分处理
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-28 10:49:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-8-28 10:01
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此 ...

好的谢谢社长提醒 下次注意

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-28 10:52:30 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-8-28 03:12
多了几个苯环可能会影响体系的自旋多重度,比如有可能文献的氮杂石墨烯是开壳层的,而且自由基在氮上,所 ...

好的谢谢您的回答 我再试下换个模型

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发表于 Post on 2023-2-15 23:34:39 | 只看该作者 Only view this author
REELM 发表于 2022-8-27 18:14
这个是我参考文献的模型

您好,方便发下这篇文献的DOI吗,我想看看

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发表于 Post on 2023-2-18 20:26:00 | 只看该作者 Only view this author
建议跑个动力学,看看哪里容易吸附

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