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[ORCA] 求助:在课题组的服务器上跑orca算到一半中断了

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Level 3 能力者

各位老师们,我们组里服务器上装了orca503和openmpi411,服务器有112个核内存情况如下图。这两天我在服务器上跑任务没跑完进程就消失了,且有很多临时文件。
分别做了一个紫外计算和一个结构优化,结构优化在自己的虚拟机上跑就没有问题,转到服务器上就不行了.

紫外计算卡到下面这一步进程就消失了,但关闭终端显示进程还未结束
998   0.0000    1620.653735     44100.2301
999   0.0000    1620.654199     44100.2428
1000   0.0000    3787.289132    103057.3766
1001   0.0000    3787.289580    103057.3888
1002   0.0000    9297.374458    252994.4210
1003   0.0000    9297.374885    252994.4326
1004   0.0000   38550.572328   1049014.4039
1005   0.0000   38550.573019   1049014.4227
Total SCF time: 0 days 0 hours 49 min 12 sec

Maximum memory used throughout the entire SCF-calculation: 324.2 MB

结构优化的文件报错如下,核数已经根据以往问这个问题的帖子改很小了
1080   0.0000     118.725563      3230.6868
1081   0.0000     118.733693      3230.9080
Total SCF time: 0 days 1 hours 0 min 17 sec

Maximum memory used throughout the entire SCF-calculation: 332.1 MB

ORCA finished by error termination in SCF
Calling Command: mpirun -np 2  /home/c427/orca503/orca_scf_mpi S0.gbw b S0
[file orca_tools/qcmsg.cpp, line 465]:
  .... aborting the run



202303301441314634..png (44.97 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

服务器内存情况

服务器内存情况

orca-uv.inp

2.14 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

这是紫外计算的inp文件

orca-uv.out

81.28 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

这是紫外计算out文件

S0.inp

2.43 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

这是紫外计算前的分子结构优化文件

S0.out

103.5 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

这是紫外计算前的分子结构优化out文件

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发表于 Post on 2023-3-30 16:42:58 | 只看该作者 Only view this author
检查openmpi安装是否有问题
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2023-3-30 17:30:01 | 只看该作者 Only view this author
试试这个方案

http://bbs.keinsci.com/thread-26418-1-1.html

如果也保存,
猜测可能是输入文件问题,或者bug
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