计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 1293|回复 Reply: 1
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[GROMACS] 求助:Amber力场参数问题

[复制链接 Copy URL]

175

帖子

0

威望

957

eV
积分
1132

Level 4 (黑子)

各位老师好,我想用Amber力场完成我的计算,就用acpype生成了几种分子的的力场文件,但是体系中含有三价铁离子,所以我去网上找到了三价铁离子的相关力场参数,请问找到的三价铁离子的力场参数怎么和我们得到的Amber力场参数对应啊?可以直接使用吗?含有就是Amber力场中的epsilon和sigma的单位是什么啊?

202305032038103396..png (143.35 KB, 下载次数 Times of downloads: 6)

acpype生成的有机分子的力场

acpype生成的有机分子的力场

202305032037348376..png (86.91 KB, 下载次数 Times of downloads: 7)

三价铁离子的力场

三价铁离子的力场

1560

帖子

0

威望

4995

eV
积分
6555

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2023-5-3 20:43:24 | 只看该作者 Only view this author
http://bbs.keinsci.com/thread-29974-1-1.html

不同开发者的参数不一样,我也不知道信谁的。但希望对你有帮助。
又菜又爱玩

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-19 06:25 , Processed in 0.199079 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list