使用CBS-QB3方法计算分子（28个原子）过于耗时问题

段家康 · 发表于 Post on 2023-5-26 19:50:45

老师，我观察输出文件里面内容如下，这个任务已经跑了两天了。想问下这是在计算什么呢。为何CBS-QB3方法计算28个原子体系会这么耗时（nproc=64，100gb）。

zjxitcc · 发表于 Post on 2023-5-26 20:22:12

本帖最后由 zjxitcc 于 2023-5-26 20:24 编辑

CCSD振幅迭代已经收敛，正在算(T)，这一步标度是O(N^7)，两天算啥

sobereva · 发表于 Post on 2023-5-26 22:51:58

CBS-QB3算这么大体系本来就很昂贵
实际上都没什么必要用CBS-QB3，用DLPNO-CCSD(T)/cc-pVQZ with tightPNO这体系早就算完了

段家康 · 发表于 Post on 2023-5-27 13:12:58

zjxitcc 发表于 2023-5-26 20:22
CCSD振幅迭代已经收敛，正在算(T)，这一步标度是O(N^7)，两天算啥

谢谢老师

段家康 · 发表于 Post on 2023-5-27 13:16:30

sobereva 发表于 2023-5-26 22:51
CBS-QB3算这么大体系本来就很昂贵
实际上都没什么必要用CBS-QB3，用DLPNO-CCSD(T)/cc-pVQZ with tightPNO ...

谢谢卢老师，我导师要求我计算的是pKa，因为以前没计算过没有经验，所以参照网上的步骤一步一步来的，我发现第一步都是用CBS-QB3计算自由能的。

sobereva · 发表于 Post on 2023-5-28 02:01:09

段家康发表于 2023-5-27 13:16
谢谢卢老师，我导师要求我计算的是pKa，因为以前没计算过没有经验，所以参照网上的步骤一步一步来的，我 ...

不要盲目套用，要知道不同方法的特点、耗时、适用性，更何况网上那些杂七杂八的教程很多都是坑爹的，或者很多关键要点根本都不交代。
仔细看下文
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327（http://bbs.keinsci.com/thread-3345-1-1.html）

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