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[ORCA] ORCA中如何进行NEB的续算

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本帖最后由 tsgyls 于 2023-6-7 17:06 编辑

之前算的neb意外终止,想要续算,看手册说用
Restart_ALLXYZFile "NEB1.allxyz"  这个关键词

我想着的是把initial_path_trj.xyz文件里的结构放到ALLXYZ里,然后用这个关键词
但是ORCA会报错

感觉我并没有理解开发者的意思
想请问一下大家续算neb的正确操作是怎么样的
ORCA输入的关键词
!PBE0 D3 6-31G**  CPCM(TOLUENE) TightSCF TightOpt
!NEB
%neb
neb_end_xyzfile "final.xyz"
Restart_ALLXYZFile "NEB1.allxyz"
end


已解决,手册与软件版本不同导致的报错,改正后可正常计算

今古北邙山下路,黄尘老尽英雄。
人生长恨水长东。
幽怀谁共语,远目送归鸿。
盖世功名将底用,从前错怨天公。
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发表于 Post on 2023-6-7 11:48:57 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Freeman 于 2023-6-7 11:50 编辑

可能是因为neb和opt关键词不兼容。请贴一下报错信息。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-7 14:10:37 | 只看该作者 Only view this author
Freeman 发表于 2023-6-7 11:48
可能是因为neb和opt关键词不兼容。请贴一下报错信息。

感谢您,报错信息我贴在一楼了,就是未识别关键词

[file orca_tools/Tool-Scanner/qcscan1.cpp, line 102]:
         Unknown identifier in NEB block line    5  :
         Last token : RESTART_ALLXYZFILE
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发表于 Post on 2023-6-7 15:42:00 | 只看该作者 Only view this author
tsgyls 发表于 2023-6-7 14:10
感谢您,报错信息我贴在一楼了,就是未识别关键词

[file orca_tools/Tool-Scanner/qcscan1.cpp, line  ...

这么看,报错信息也许是.allxyz文件格式不对。

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发表于 Post on 2023-6-7 15:49:40 | 只看该作者 Only view this author
tsgyls 发表于 2023-6-7 07:10
感谢您,报错信息我贴在一楼了,就是未识别关键词

[file orca_tools/Tool-Scanner/qcscan1.cpp, line  ...

这种报错表示程序不认识RESTART_ALLXYZFILE这个关键词(如果allxyz文件格式错误,报错信息不会这么写)。但鉴于orca手册里提到了这个关键词,程序不应该不认识。会不会是你跑的orca版本太低,比orca手册的版本低?如果不是的话,可能是程序的bug,可以在orca论坛上发个帖
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-7 17:05:21 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-6-7 15:49
这种报错表示程序不认识RESTART_ALLXYZFILE这个关键词(如果allxyz文件格式错误,报错信息不会这么写)。 ...

感谢解答,就是版本的问题,节点上装了两个版本所以出错了,改正后就没有报错了
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-7 17:07:39 | 只看该作者 Only view this author
Freeman 发表于 2023-6-7 15:42
这么看,报错信息也许是.allxyz文件格式不对。

是手册和软件版本不同导致的问题,改正后就可以正常计算
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幽怀谁共语,远目送归鸿。
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