计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 8756|回复 Reply: 12
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 拉曼光谱加弥散时,怎么计算极化率导数

[复制链接 Copy URL]

13

帖子

0

威望

77

eV
积分
90

Level 2 能力者

在老师量子化学中关于基组的选择方法这篇文章中,我看到了关于拉曼光谱的一段话,“J. Chem. Theory Comput., 7, 3323 (2011)提出计算Raman、ROA的两步方法,在优化和振动分析时不用弥散函数(低至6-31G*高至def-TZVP就够),但是计算极化率导数的时候再考虑弥散函数(建议>= aug-cc-pVDZ)”

其中我不是很懂怎么计算极化率导数的时候考虑弥散函数,我所做的需要计算分子的拉曼光谱
我是先进行了结构优化
#p b3lyp/6-311g** opt(gdiis,maxstep=3,notrust,recalc=5) EmpiricalDispersion=GD3BJ out=wfn
然后需要进行拉曼计算,需要加弥散函数,但是看文章说振动时方法必须和优化一致,所以拉曼也只能用b3lyp/6-311g**,即#p b3lyp/6-311g** empiricaldispersion=gd3bj freq=raman
请问老师我想在算拉曼时加弥散函数应该怎么做呢

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2020-9-7 13:07:07 | 只看该作者 Only view this author
至少截止到G16 C.01为止,两步法算Raman的功能都有bug,没法直接用。但两步法算ROA的功能正常,同时也会输出Raman

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

13

帖子

0

威望

77

eV
积分
90

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-9-7 19:42:15 | 只看该作者 Only view this author
谢谢老师,十分感谢sob老师,祝老师工作顺利

156

帖子

0

威望

3405

eV
积分
3561

Level 5 (御坂)

4#
发表于 Post on 2020-9-15 01:04:34 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-9-7 13:07
至少截止到G16 C.01为止,两步法算Raman的功能都有bug,没法直接用。但两步法算ROA的功能正常,同时也会输 ...

社长,ORCA 能用类似的方法两步法算拉曼吗?最近有个体系需要算拉曼,体系偏大, 高斯要算很久很久。不知道ORCA 能否降低一些耗时。

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2020-9-16 09:24:52 | 只看该作者 Only view this author
indec 发表于 2020-9-15 01:04
社长,ORCA 能用类似的方法两步法算拉曼吗?最近有个体系需要算拉曼,体系偏大, 高斯要算很久很久。不知 ...

ORCA应该不行。而且ORCA的振动分析速度远不如它算能量和受力,到了算Hessian的场合,相对于Gaussian的速度优势会失去大半,甚至有时还可能更慢。另外,ORCA用DFT算Raman应该是基于有限差分算的Raman活性(我没仔细证实过),因为这涉及到三阶导数,从这点上也不如Gaussian,Gaussian可以解析地计算。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

13

帖子

0

威望

77

eV
积分
90

Level 2 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-20 09:16:13 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-9-7 13:07
至少截止到G16 C.01为止,两步法算Raman的功能都有bug,没法直接用。但两步法算ROA的功能正常,同时也会输 ...

老师  请问在第一步中   先优化完 然后再计算振动freq可以吗  然后再进行第二步

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

7#
发表于 Post on 2020-10-21 11:38:03 | 只看该作者 Only view this author
wangchunchun 发表于 2020-10-20 09:16
老师  请问在第一步中   先优化完 然后再计算振动freq可以吗  然后再进行第二步

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

13

帖子

0

威望

77

eV
积分
90

Level 2 能力者

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-2 11:05:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-9-7 13:07
至少截止到G16 C.01为止,两步法算Raman的功能都有bug,没法直接用。但两步法算ROA的功能正常,同时也会输 ...

老师,我用您的ROA例子试着算了一下,加了色散和溶剂,但是在加溶剂的情况下就算画不出拉曼的图像,请问老师这个我应该怎么解决呢
optfreq:#p B3LYP/6-31G* opt freq EmpiricalDispersion=GD3BJ scrf=(smd,solvent=n-hexane)
polar:#p B3LYP/aug-cc-pVDZ polar=ROA guess=read geom=check EmpiricalDispersion=GD3BJ scrf=(smd,solvent=n-hexane)

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

9#
发表于 Post on 2020-11-2 13:19:51 | 只看该作者 Only view this author
wangchunchun 发表于 2020-11-2 11:05
老师,我用您的ROA例子试着算了一下,加了色散和溶剂,但是在加溶剂的情况下就算画不出拉曼的图像,请问 ...

这和色散校正没关系。
看看输出文件中拉曼活性有没有输出
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

13

帖子

0

威望

77

eV
积分
90

Level 2 能力者

10#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-2 20:48:45 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-11-2 13:19
这和色散校正没关系。
看看输出文件中拉曼活性有没有输出

老师    我用gview打开out文件  是有拉曼活性的   raman activity  ,但是用Multiwfn画图画不出来,不加溶剂计算的结果就能画出来

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

11#
发表于 Post on 2020-11-4 14:13:48 | 只看该作者 Only view this author
wangchunchun 发表于 2020-11-2 20:48
老师    我用gview打开out文件  是有拉曼活性的   raman activity  ,但是用Multiwfn画图画不出来,不加 ...

仔细看到底运行正常结束了没有。
说不清楚就把输出文件压缩后上传,我看看
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

168

帖子

0

威望

1345

eV
积分
1513

Level 5 (御坂)

12#
发表于 Post on 2023-9-8 16:34:26 | 只看该作者 Only view this author
请教一下,拉曼活性和极化率以及极化率导数之间有什么关系吗?有没有一组公式可以说明?谢谢

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

13#
发表于 Post on 2023-9-8 22:16:49 | 只看该作者 Only view this author
大头攒毛 发表于 2023-9-8 16:34
请教一下,拉曼活性和极化率以及极化率导数之间有什么关系吗?有没有一组公式可以说明?谢谢


参考北京科音初级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KEQC_content.html)ppt


北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-24 02:46 , Processed in 0.211940 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list