使用sobEDA做能量分解出现错误

catalyze · 发表于 Post on 2023-9-16 20:56:10

本帖最后由 catalyze 于 2023-9-18 11:19 编辑

老师好，我在使用sobEDAw做能量分解做能量分解的时候遇到了点问题。
使用的是g16版本，Multiwfn和dos2unix命令都可以正常使用，但是输出文件总是提示读取不到输入文件，尝试用sob老师在教程中给的例子也是得到的了一样的结果。

LIEL · 发表于 Post on 2023-9-16 22:50:04

你的sobEDA肯定有内容被你改动了，你重新下一个sobEDA.sh就行了

sobereva · 发表于 Post on 2023-9-16 23:14:48

那不叫读不到文件，而是Gaussian没找到gjf文件里的route section部分，即关键词部分
考虑到连例子文件都没法运行，如楼上所说，大概率是你自己概率把脚本改乱了

catalyze · 发表于 Post on 2023-9-18 08:29:40

LIEL 发表于 2023-9-16 22:50
你的sobEDA肯定有内容被你改动了，你重新下一个sobEDA.sh就行了

您好，我刚刚新下载了sob老师提供的脚本文件，之后在文件夹中给的例子里操作了一下(对sobEDA.sh完全没有改动），之后还是出现了一样的提示，不知道是什么原因。

LIEL · 发表于 Post on 2023-9-18 08:49:13

catalyze 发表于 2023-9-18 08:29
您好，我刚刚新下载了sob老师提供的脚本文件，之后在文件夹中给的例子里操作了一下(对sobEDA.sh完全没有 ...

你确定你的Multiwfn是在“Multiwfn”这个命令下可以正常运行吗，不是你的Multiwfn设置有问题就是sobEDA.sh里面的Multiwfn的命令写错了。例如：noGUI版的Multiwfn的命令应该是“Multiwfn_noGUI”。

manying · 发表于 Post on 2023-9-18 09:33:50

同学这个问题解决了吗，我之前也遇到同样的报错。例子文件也无法运行，

catalyze · 发表于 Post on 2023-9-18 09:47:22

LIEL 发表于 2023-9-18 08:49
你确定你的Multiwfn是在“Multiwfn”这个命令下可以正常运行吗，不是你的Multiwfn设置有问题就是sobEDA.s ...

是直接在Multiwfn命令下运行的，dos2unix 命令也可以正常运行。

catalyze · 发表于 Post on 2023-9-18 09:47:51

manying 发表于 2023-9-18 09:33
同学这个问题解决了吗，我之前也遇到同样的报错。例子文件也无法运行，

还没有

sobereva · 发表于 Post on 2023-9-18 11:05:24

catalyze 发表于 2023-9-18 09:47
是直接在Multiwfn命令下运行的，dos2unix 命令也可以正常运行。

“直接在Multiwfn命令下运行的”语义不明

把脚本内容读明白，自然知道怎么结合实际情况解决。远程很难说清楚，无非就是没严格按教程说的准备输入文件或运行环境所致。

LIEL · 发表于 Post on 2023-9-18 11:08:07

catalyze 发表于 2023-9-18 09:47
是直接在Multiwfn命令下运行的，dos2unix 命令也可以正常运行。

g16能正常运行吗，我用你提供的文件运行是没问题的

catalyze · 发表于 Post on 2023-9-18 11:09:56

sobereva 发表于 2023-9-18 11:05
“直接在Multiwfn命令下运行的”语义不明

把脚本内容读明白，自然知道怎么结合实际情况解决。远程很难 ...

老师，这里我是想说Multiwfn程序是在“Multiwfn”命令下可以正常运行的，gaussian也可以通过g16命令正常调用，dos2unix命令也可以正常使用

catalyze · 发表于 Post on 2023-9-18 11:21:59

LIEL 发表于 2023-9-18 11:08
g16能正常运行吗，我用你提供的文件运行是没问题的

您好，我更新了问题中的图片，Multiwfn和g16都可以运行

sobereva · 发表于 Post on 2023-9-18 11:30:32

catalyze 发表于 2023-9-18 11:21
您好，我更新了问题中的图片，Multiwfn和g16都可以运行

使用sobEDA和sobEDAw方法做非常准确、快速、方便、普适的能量分解分析
http://sobereva.com/685（http://bbs.keinsci.com/thread-39446-1-1.html）

还是没好好看上文

(3)机子里已正常安装Multiwfn，比如直接输入Multiwfn命令就可以正常启动。Multiwfn可以在http://sobereva.com/multiwfn免费下载，必须是2023-Jun-25以后更新的版本。安装方法见Multiwfn手册2.1.2节。图安装省事也可以装noGUI版，此时不需要额外装任何图形库，但此版本的Multiwfn不具备任何和作图有关的功能和图形界面。

LIEL · 发表于 Post on 2023-9-18 12:33:47

catalyze 发表于 2023-9-18 11:21
您好，我更新了问题中的图片，Multiwfn和g16都可以运行

如社长所说，版本问题

catalyze · 发表于 Post on 2023-9-18 14:24:53

sobereva 发表于 2023-9-18 11:30
使用sobEDA和sobEDAw方法做非常准确、快速、方便、普适的能量分解分析
http://sobereva.com/685（http:/ ...

谢谢老师，刚确认了服务器上的Multiwfn是今年六月份之前安装的，是版本问题

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