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[Gaussian/gview] 限制优化时出现原子重叠

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本帖最后由 @123 于 2023-10-22 12:04 编辑

请教一下各位前辈,在找过渡态的时候发现虚频振动方向不对,调整结构还是没有找到理想的虚频。于是准备通过先限制优化再搜索过渡态的方式找过渡态。烯烃吸附到rh催化剂上,先固定了rh和双键其中一个C的距离(固定rh和双键上两个c的距离时也出现了重叠的问题),结果优化到第八九步的时候结构就乱掉了。我尝试换过一次泛函,一开始用的b3lyp-d3(bj),结构也是乱掉了。请问这是什么问题,如何解决。谢谢!图是优化后的
这是输入文件
# opt=modredundant pbe1pbe/genecp empiricaldispersion=gd3bj
电荷0 自旋多重度1

B 1 34 F

Rh 0
SDDALL
****
C H Cl S P 0
6-31G*
****

Rh 0
sdd

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发表于 Post on 2023-10-22 10:28:28 | 只看该作者 Only view this author
能截图展示输入文件坐标底下的坐标限制、自定义基组和赝势信息吗?方便看空行数目正确与否。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-22 12:03:26 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2023-10-22 10:28
能截图展示输入文件坐标底下的坐标限制、自定义基组和赝势信息吗?方便看空行数目正确与否。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-22 12:04:33 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2023-10-22 10:28
能截图展示输入文件坐标底下的坐标限制、自定义基组和赝势信息吗?方便看空行数目正确与否。

我将截图补充在上面了

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发表于 Post on 2023-10-23 00:36:44 | 只看该作者 Only view this author

根本没上传图片
你写本地图片的路径,远程的人怎么可能看到你的图片
仔细看置顶的社员必读贴弄清楚怎么贴图


只可能基组或赝势定义有问题,没正确被Gaussian读取。直接上传输入文件。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-25 20:09:58 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-10-23 00:36
根本没上传图片
你写本地图片的路径,远程的人怎么可能看到你的图片
仔细看置顶的社员必读贴弄清楚怎么 ...

重新检查了文件,发现是输入文件的问题,谢谢老师的解答,关于贴图的问题以后会注意,谢谢老师

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