计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 534|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[GAMESS-US] LMOEDA报错问题

[复制链接 Copy URL]

26

帖子

0

威望

349

eV
积分
375

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本人利用xacs的xeda计算LMOEDA,输入文件如下,报错信息如下,看完报错信息还是不知道问题所在,求大神指导 11inp.zip (4.23 MB, 下载次数 Times of downloads: 6) 11err.zip (1.43 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)


3811

帖子

4

威望

8000

eV
积分
11891

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

2#
发表于 Post on 2023-11-3 17:22:22 | 只看该作者 Only view this author
你这输入文件看着很奇怪哇,主体内容像是MOKITfrag_guess_wfn生成的,但前几行被大改了,看上去很不对。建议说明以下信息:
(1)做了什么修改,为何要改(frag_guess_wfn自动生成的文件已经很严谨了,无需修改可直接提交给XEDA)
(2)你想做什么计算?LMO-EDA还是GKS-EDA?如果是前者,那你是想做基于RHF的,还是MP2的,还是CCSD的?


自动做多参考态计算的程序MOKIT

26

帖子

0

威望

349

eV
积分
375

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-3 19:27:38 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2023-11-3 17:22
你这输入文件看着很奇怪哇,主体内容像是MOKIT的frag_guess_wfn生成的,但前几行被大改了,看上去很不对。 ...

老师,我这个是用fch2inp生成的,然后加了$LMOEDA MATOM(1)=2 51 MCHARG(1)=4 -7 MMULT(1)=1 1 $END(我第一次没加这行命令通进去也是失败了,所以我以为是没有LMOEDA命令的缘故)。因为我不清楚frag_guess_wfn生成的和fch2inp生成的有什么区别,加上我下在了预编译widows版以后发现没办法将fchk拖动到frag_guess_wfn里让它生成inp文件,但fch2inp可以,所以就使用了fch2inp。
老师,我想做LMO-EDA,基于RHF的。还请老师指教,谢谢老师啦

3811

帖子

4

威望

8000

eV
积分
11891

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

4#
发表于 Post on 2023-11-3 19:48:10 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zjxitcc 于 2023-11-3 19:52 编辑
Are 发表于 2023-11-3 19:27
老师,我这个是用fch2inp生成的,然后加了$LMOEDA MATOM(1)=2 51 MCHARG(1)=4 -7 MMULT(1)=1 1 $END(我 ...

LMO-EDA和GKS-EDA计算需要有多套轨道,所以需要frag_guess_wfn小程序调用Gaussian做多次计算,然后传多套轨道,并产生关键词和隐式溶剂参数(如果有用到的话)。你喂给fch2inp一个fch文件,这顶多只能传1套轨道,远远不够EDA计算所需,而且当前关键词与自动产生的合理关键词差很远。

建议仔细阅读MOKIT手册https://jeanwsr.gitlab.io/mokit-doc-mdbook/chap5-3.html,先从手册里的示例文件开始学习。另外,基于RHF的LMO-EDA虽然可以算,但无实际意义,精度过于糟糕,现在XEDA里最推荐的是GKS-EDA。

fch2inp只传一套轨道,耗时是瞬间的。而frag_guess_wfn需要调用量化程序做计算然后多次调fch2inp挨个传轨道,时间是不可忽略的(当然,比纯用GAMESS做计算要快)。frag_guess_wfn既可在Windows下使用(不是鼠标拖动,是要写好环境变量然后在命令行里运行之),也可以在Linux下使用,不过为了高效计算起见,还是建议到Linux下使用。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

26

帖子

0

威望

349

eV
积分
375

Level 3 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-3 21:17:49 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2023-11-3 19:48
LMO-EDA和GKS-EDA计算需要有多套轨道,所以需要frag_guess_wfn小程序调用Gaussian做多次计算,然后传多套 ...

感谢老师的回复。阅读完手册还是有个问题想问老师,~/.bashrc这个文件是需要下载Python3才能找到吗?

3811

帖子

4

威望

8000

eV
积分
11891

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

6#
发表于 Post on 2023-11-3 21:30:16 | 只看该作者 Only view this author
Are 发表于 2023-11-3 21:17
感谢老师的回复。阅读完手册还是有个问题想问老师,~/.bashrc这个文件是需要下载Python3才能找到吗?

这属于Linux基本常识问题,与python无关。~/.bashrc文件是Linux系统自带的、给每个用户的环境变量配置文件。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-26 06:04 , Processed in 0.168323 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list